Théorie ya bansangu ke tadila mambu ya mfunu ya théorie ya lutaninu ya banti sambu na metabolism .

Ba theorie ya mutindu na mutindu ya kutanina ba yinti ke pesa lutwadisu ya mfunu ya theorie samu na kutendula mutindu ya kusadila bima ya yinti, kansi ba nsangu ya bau ya mfunu me bikana na kumekama. Awa, beto sadilaka lusalusu ya mvingu ya bantu (MS/MS) samu na kusosa na mutindu mosi ya kusungama mutindu ya kusadila ba mvingu ya makaya yina me lemba katuka na ba yinti mosi mosi tii na bimvuka ya bantu mpe bibulu yina kele na nguizani ya mbote, mpe beto salaka ntalu ya nene ya ba théorie ya bifu ya mvingu ya bantu yina me simbama na ba mvingu ya bantu yina kele na bansangu. Kadre ya kumeka ba nsangu ya mfunu ya ba théorie ya lutaninu ya mbote (OD) mpe ya nzila ya kutambula (MT). Kitini ya bansangu ya mvingu ya bantu ke kwenda nzila mosi na théorie ya OD, kansi yau ke buya nsangu ya nene ya théorie ya MT na yina me tala mvingu ya bantu yina ke katukaka na bibulu ke diaka matiti. Banda na kitezo ya ntungulu ya fioti tii na ya nene, kidimbu ya jasmonate zabanaka bonso kima ya ntete ya ke sadisaka na kuzaba OD, na ntangu kidimbu ya éthylène pesaka nzila ya kuyidika mbote mvutu ya sikisiki ya bibulu yina ke diaka matiti yina bo me sonikaka na nzila ya réseau moléculaire ya MS/MS.
Ba metabolites ya sipesiali yina kele na bima ya mutindu na mutindu kele bima ya ntete yina ke sadisaka ba yinti na kuyikama na kisika yina ba ke zingaka, mingi-mingi na kutanina bambeni (1). Kuswaswanisa ya kuyituka ya mutindu ya kuyidika bima yina ke monanaka na banti me pusa bamvula mingi na bansosa ya mudindu na mambu mingi ya bisalu na yo ya ekolozi, mpi me sala liste ya nda ya malongi ya kutanina banti, yina kele evolisio mpi kuyela ya ekolozi ya bangwisana ya banti ti baniama. Bansosa ya bo me salaka ke pesaka lutwadisu ya mfunu (2). Kasi, ba théorie yayi ya kutanina ba yinti landaka ve nzila ya nsiku ya kuyindula ya deduction hypothétique, na kati ya yau ba nsangu ya mfunu vuandaka na niveau mosi ya kufiongunina (3) mpe ba mekaka yau na nzila ya kumeka samu na kukwenda na ntwala na nzietolo ya kulanda ya kutunga ba théorie (4). Ba bandilu ya tekiniki ke kanga nzila na kuvukisa bansangu na ba ndonga ya sikisiki ya bima ya ke sadisaka na nitu mpe ke katulaka lusalusu ya mvimba ya ba ndonga ya bima ya nkaka, yau ke kangaka nzila na kufwanisa kati ya ba ndonga yina kele mfunu samu na kutunga théorie (5). Kukonda ya bansangu ya mvimba ya metabolomique mpe mbongo mosi ya kufwanisa mutindu ya kusala kisalu ya kisika ya metabolique na kati ya bimvuka ya ba yinti ya mutindu na mutindu ke kanga nzila na kuyela ya siansi ya bilanga.
Ba nsangu ya nsuka na yina me tala nsangu ya mvingu ya bantu (MS/MS) lenda monisa na mutindu ya mvimba bansoba ya mvingu ya bantu na kati mpe na kati ya mitindu ya clade ya ngidika mosi, mpe lenda vukana na ba nzila ya kusadila ba nsangu samu na kuzaba mutindu ya kufwanana ya ntungulu na kati ya bima yayi ya mpasi ya kuvukisa. Kuzaba ntete mambu ya chimie (5). Kuvukisa ba tekinolozi ya ntama na yina me tala kufiongunina mpe kusadila ba ordinatere ke pesa nzila ya mfunu samu na kumeka na ntangu ya yinda ba nsangu mingi yina me salama na ba théorie ya ekolozi mpe ya ntungulu ya mutindu ya kuswaswana ya bima yina ke tambulaka na nitu. Shannon (6) kotisaka dilongi ya bansangu sambu na mbala ya ntete na disolo na yandi ya mfunu na mvu 1948, mpi yandi tulaka fondasio sambu na kutadila bansangu na nzila ya matematike, yina bo me sadilaka na mambu mingi ya nkaka katula kaka mutindu bo sadilaka yo na luyantiku. Na yina metala génomique, bo mesadilaka mbote-mbote dilongi ya bansangu sambu na kuzaba ntalu ya bansangu yina kelandanaka (7). Na bansosa ya bo ke salaka na mambu yina bo ke sonikaka, théorie ya bansangu ke tadilaka bansoba yonso yina ke salamaka na mambu yina bo ke sonikaka (8). Na bansosa ya ntete, beto sadilaka nzila ya statistique ya théorie ya bansangu na metabolomie sambu na kutendula mayele ya metabolique ya nivo ya mikanda na banti (9). Awa, beto ke vukisa nzila ya kisalu yina me simbama na MS/MS na nzila ya statistique ya théorie ya ba nsangu, yina ke zabanaka na mutindu ya kuswaswana ya ba mvingu ya bantu na mbongo ya bantu nyonso, samu na kufwanisa ba nsangu ya mfunu ya théorie ya lutaninu ya ba yinti ya mvingu ya bantu yina ke katukaka na ba nyama yina ke diaka matiti.
Ba nzila ya théorie ya lutaninu ya ba yinti ke vuanda mingi mingi na kati na yau mpe lenda kukabwana na ba ndonga zole: yina ke meka kutendula kukabula ya ba metabolites ya ba yinti yina me simbama na bisalu ya kutanina, mutindu lutaninu ya mbote (OD) (10), kima ya ke tambula (MT) (11) ) Mpe kumonana ya mutindu ya nkaka na ntangu ya kusosa na, kuvanda na yau ke na bupusi na kuyela ya ba yinti mpe na kuvukisa ya bima ya sipesiali, mutindu carbone: ngindu ya bumosi ya madia (13), ngindu ya ntalu ya kukula (14 ), mpe ngindu ya bumosi ya kuyela mpe ya kuswaswanisa (15). Bimvuka zole ya malongi kele na nivo ya kuswaswana ya kutadila (4). Na yau, ba théorie zole yina ke tadila bisalu ya kutanina na niveau ya kisalu ke yala masolo na yina me tala lutaninu ya ba yinti yina ke salaka mpe yina ke katukaka na ba yinti: theorie ya OD, yina ke banzaka ti ba yinti ke tula mbongo na ba inziti ya bawu ya ntalu mingi kaka kana yau kele mfunu, na kifwani, ntangu ba ke kudia yau Ntangu kibulu ya matiti ke nwanisa, na yina, na kulandana na bilumbu ke kwisa na nzila ya kisalu ya bo me pesa (10); hypothèse ya MT ke pesa ngindu ti, kele ve na axis ya kusoba ya nzila ya mvingu ya bantu, kansi mvingu ya bantu ke sobaka na mutindu ya kukonda kukana, yau ke sala nzila ya Kukanga nzila na “cible de mouvement” ya mvingu ya bantu ya kunwanisa ba mbisi yina ke diaka matiti. Na kutuba ya nkaka, ba théorie zole yayi ke tuba mambu ya kuswaswana na yina me tala kubongisa diaka bima ya nitu yina ke salamaka na nima ya kunwanisa ya ba mbisi yina ke diaka matiti ya bilanga: kuwakana na kati ya kuvukisa bima ya nitu na nzila mosi yina kele na kisalu ya kutanina (OD) mpe bansoba ya bima ya nitu yina ke kwendaka ve na nzila (MT) (11 ).
Ba ngindu ya OD na MT ke tadila kaka ve bansobolo yina me salama na kati ya bima ya mvingu ya bantu, kansi mpe ba mbutu ya mvingu ya bantu na yina me tala mvingu ya bantu, mutindu ba ntalu ya kufwanana mpe mambote ya bansobolo yayi ya mvingu ya bantu na kifulu mosi ya mvingu ya bantu (16). Ata ba ngindu nyonso zole ke ndima kisalu ya kutanina ya ba metabolites ya sipesiali, yina lenda to lenda vanda ve ntalu mingi, nsangu ya mfunu yina ke swaswanisaka ba ngindu ya OD na MT kele na nzila ya ba nsobolo ya metabolites yina me salama. Kubikula ya théorie ya OD me baka dikebi ya kuluta mingi ya kumeka tii bubu yai. Ba test yayi kele na kulonguka ya bisalu ya lutaninu ya mbala mosi to ya kukonda mbala mosi ya ba nsinga ya mutindu na mutindu ya bima ya sikisiki na kati ya ba inzo ya vert mpe mambu ya kimuntu, mpe bansobolo na kitini ya kukula ya ba yinti (17-19). Kasi, tii bubu yayi, samu na kukonda ya nzila ya kisalu mpe ya ba ntalu samu na kufiongunina na yinza ya muvimba mutindu ya kuswaswana ya bima ya nzutu ya konso kibulu, luswaswanu ya nene ya kuzabisa na kati ya ba théorie zole (yina kele, nzila ya kusoba ya bima ya nzutu) me bikana na kumekama. Awa, beto ke pesa analize ya mutindu yina.
Mosi ya bifu ya mfunu ya ba metabolites ya ba yinti kele mutindu na bau ya kuluta mingi ya ba ntungulu na ba niveau nyonso banda na ba yinti mosi mosi, na ba kimvuka ti na ba mitindu ya mutindu mosi (20). Ba nsobolo mingi ya ntalu na ba metabolites ya sipesiali lenda monana na kitezo ya bantu, na ntangu yina ba luswaswanu ya ngolo ya kikalulu ke bumbanaka mbala mingi na kitezo ya bibulu (20). Na yina, mutindu ya kuswaswana ya ba yinti kele kitini ya ntete ya mutindu na mutindu ya bisalu, yina ke monisa mutindu ya kufwanana na bisika ya kuswaswana, mingi mingi bisika yina kele na ba nzila ya kukota ya mutindu na mutindu na ba insecte ya sipesiali mpe ba mbisi yina ke diaka matiti mingi (21). Banda disolo ya ntete ya Fraenkel (22) na yina me tala bikuma ya kuvanda ya bima yina ke sadisaka nitu na kuzinga, bantu ke monaka nde bangwisana ti baniama ya mutindu na mutindu kele bupusi ya mfunu ya kupona, mpi bo ke yindulaka nde bangwisana yai me pesaka bayinti kifwani na ntangu ya evolisio. Nzila ya kubalula bima (23). Kuswaswana na kati ya ba bibulu na mutindu ya kuswaswana ya ba metabolites ya sipesiali lenda mpe kumonisa bumosi ya fiziolozi yina kele na nguizani na lutaninu ya ba yinti yina ke salaka mpe yina ke kotaka na ba nzila ya kudia matiti, mutindu ba bibulu zole yayi ke vuanda mbala mingi na nguizani ya yimbi na kati na bau (24). Ata yau lenda vanda mbote na kutanina lutaninu ya mbote ntangu nyonso, bansobolo ya mvingu ya bantu na ntangu ya mbote yina kele na nguizani na lutaninu ke pesa mambote ya pwelele na kupesa nzila na ba yinti na kukabula bima ya mfunu na ba mbongo ya nkaka ya fiziolozi (19, 24), mpe kubuya mfunu ya kusala kintuadi. Kubebisa mambu (25). Na zulu ya yau, kubongisa diaka yayi ya ba metabolites ya sipesiali yina ke katukaka na ba nsusu yina ke diaka matiti lenda nata kukabula ya kufwa na kati ya bantu (26), mpe lenda monisa kutanga ya mbala mosi ya ba nsobolo ya nene ya kimuntu na kidimbu ya acide jasmonique (JA), yina lenda tanina na kati ya bantu. Ba nsangu ya JA ya zulu mpe ya nsi kele ba nsinsani na kati ya kuditanina na bibulu ke diaka matiti mpe kutesana na bibulu ya sikisiki (27). Na zulu ya mambu yina, banzila ya sipesiali ya biosynthèse ya bima ya ke sadisaka nitu ta vila mpi ta soba nswalu na nsungi ya evolisio, ebuna yo ta sala nde bima ya nkaka kukabwana na bitini-bitini na kati ya bambisi yina ke wakana ngolo (28). Ba polymorphisme yayi lenda kutulama nswalu na mvutu ya kusoba ya ba nzila ya kudia matiti (29), yina ke zola tuba ti kusoba ya bimvuka ya ba mbisi ya kudia kele kima ya mfunu ke nata hétérogénéité métabolique.
Awa, beto manisaka na sikisiki yonso bampasi yai ke landa. (I) Inki mutindu nsusu yina ke diaka matiti ke yidikaka diaka bima yina ke vandaka na kati ya nti? (Ii) Inki kele bima ya mfunu ya bansangu ya ke tadila plastisite ya metabolique yina bo lenda tanga sambu na kumeka mambu yina bo ke tubaka na ntwala ya théorie ya lutaninu ya ntangu mingi? (Iii) Kana bo fwete yidika diaka bima yina ke sadisaka nitu na kuyidika nitu na mutindu mosi ya me swaswana ti muntu yina ke nwanisa yo, kana mpidina, inki kisalu hormone ya nti ke salaka sambu na kuyidika mvutu mosi ya siki-siki ya nitu, mpi nki bima yina ke sadisaka nitu na kuditanina? (Iv) Samu ti ba nsangu me salama na ba théorie mingi ya lutaninu lenda kwenda na ba niveau nyonso ya ba tissus biologiques, beto yufulaka inki mutindu mvutu ya metabolique yina me katuka na kufwanisa ya kati na kufwanisa ya ba nyama? Na yina me tala, beto me longuka na mutindu mosi ya kusungama mutindu ya kusadila matiti ya makaya, yina kele kifwani ya kifulu yina kele na mutindu ya kusadila bima ya mutindu na mutindu, mpe yau ke sadisaka na kunwanisa ba lumba ya ba mbisi zole ya ke diaka matiti ya bwala, Lepidoptera Datura (Ms) ( Yau ke nwanisaka mingi, mingi mingi ke kudiaka) Na Solanaceae ya kibulu ya makaya mpe Spodo “kimuntu”, na ba yinti ya kuyamba ba Solanaceae na ba yinti ya nkaka ya ba mbuta ya nkaka na mabuta Madya ya ba yinti. Beto me fimpa nzila ya MS/MS mpe beto me katula ba nsangu ya ke tendula ba nsangu samu na kufwanisa ba nsangu ya OD mpe ya MT. Kusala bakarte ya sikisiki sambu na kumonisa kimuntu ya ba metabolite ya mfunu. Kufiongunina yayi me kwenda na bantu ya kisina ya N. nasi mpe ba mitindu ya makaya yina kele na nguizani ya mbote samu na kufiongunina diaka mutindu ya kuswaswana na kati ya nsangu ya ba hormone ya ba yinti mpe kupesa OD.
Na yina me tala kukanga karte ya mvimba na yina me tala plastisite mpe ntungulu ya metabolome ya matiti ya makaya yina ke diaka matiti ya bilanga, beto sadilaka mutindu ya kusala kisalu ya kufiongunina mpe ya kusala ba calcul yina beto salaka ntete samu na kuvukisa mpe kukatula na mutindu ya mvimba bansangu ya ngolo yina kele na kimpwanza ya ba spectre ya MS/MS yina ke katukaka na ba mbuma ya ba yinti ( 9 ). Metode yayi ya kukonda kuswaswana (yina bo ke bingaka MS/MS) lenda tunga ba spectre ya bima ya ke vutukilaka ve, yina lenda salama na nima sambu na ba analyse yonso ya nivo ya bima yina bo me tubila awa. Ba bima yai ya ke katukaka na ba nti yina kele ya mitindu mingi, yina ke vandaka ti bima ya nkaka nkama tii na mafunda (kiteso ya 500-1000-s/MS/MS awa). Awa, beto ke tadila plastisite ya mvingu ya bantu na kati ya ntuala ya théorie ya bansangu, mpe kuzaba ntalu ya mutindu na mutindu mpe kisalu ya mvingu ya bantu na kulandaka entropie ya Shannon ya kukabula ba mbala ya mvingu ya bantu. Na kusadilaka formule yina bo sadilaka ntete (8), beto salaka calcul ya kimvuka ya bidimbu yina lenda sadisa na kuzaba kiteso ya mutindu ya kuswaswana ya bima yina ke basikaka na nitu (kidimbu ya Hj), mutindu ya kuyidika bima ya nitu (kidimbu ya δj) mpi mutindu ya kuyidika bima ya nitu ya kima mosi (kidimbu ya Si) . Na zulu ya yau, beto sadilaka Index ya plastisite ya ntama (RDPI) samu na kuzaba kitezo ya mvingu ya bantu yina ke diaka matiti (Kifwanisu 1A) (30). Na kati ya nzila yayi ya ntalu, beto ke bakaka nzila ya MS/MS mutindu kitini ya nsangu ya ntete, mpe ke sadilaka ntalu ya mingi ya MS/MS na kati ya mukanda ya kukabula ya ba mbala, mpe na manima beto ke sadilaka entropie ya Shannon samu na kuzaba mutindu ya kuswaswana ya bima yina ke tambulaka na nitu na kati na yau. Kuzaba ya metabolome ke tesamaka na nzila ya mwayene ya kimuntu ya MS/MS mosi. Na yina, kukula ya bumbidi ya ba ndonga ya nkaka ya MS/MS na manima ya kukotisa ba mbisi ya ke diaka bibulu ke balukaka na ku kotisa ba mbisi ya mvingu ya bantu, RDPI na ku kotisa ba mbisi ya mutindu mosi, ni yina, kukula ya index ya δj, samu ti ba metabolites ya mutindu mingi ke basikaka mpe index ya Si ya ngolo ke basikaka. Kukulumuka ya index ya mutindu na mutindu ya Hj ke monisa ti to ntalu ya MS/MS yina me basika ke kulumuka, to kukabula ya ba mbala ya profil ke soba na nzila ya kukonda mutindu mosi, na ntangu mosi ke kulumusa kivuvu na yau nyonso. Na nzila ya calcul ya index ya Si, yau lenda monisa inki MS/MS ke pesamaka na ba mbisi ya nkaka ya ke diaka matiti, na kifuani, inki MS/MS ke pesaka ve mvutu na kupesa, yina kele kidimbu ya mfunu samu na kuswaswanisa MT na OD ya kuzabisa.
(A) Ba ntendula ya ba ntalu yina ba ke sadilaka samu na ba mbisi yina ke diaka matiti (H1 tii na Hx) MS/MS yina ke pesaka bansangu (RDPI), mutindu ya kuswaswana (index ya Hj), mutindu ya kuzaba mambu (index δj) mpe mutindu ya kuzaba mambu (index Si). Kukula ya kitezo ya kuzaba kisalu (δj) ke monisa ti, na mwayene, ba bima mingi ya sikisiki ya ke diaka matiti ke basika, na ntangu yina kukulumuka ya mutindu na mutindu (Hj) ke monisa kukulumuka ya bima ya ke sadisaka na nitu to kukabula ya bima ya ke sadisaka na nitu na mutindu ya kufwanana ve na karte ya kukabula . Ntalu ya Si ke tala kana metabolite kele ya sikisiki sambu na kimbefo mosi buna (awa, ke diaka matiti ya bilanga) to na ndambu ya nkaka, yo ke taninaka yo na nivo mosi. (B) Diagrame ya mabanza ya théorie ya lutaninu na kusadilaka axis ya théorie ya bansangu. Théorie ya OD ke tuba nde kunwanisa ya bambisi yina ke diaka matiti ta sala nde bima yina ke taninaka nitu kukuma mingi, ebuna yo ta sala nde δj kukuma mingi. Na ntangu yina mosi, Hj ke kulumuka sambu bo ke yidika diaka profil na nzila ya kukulumusa kukonda kivuvu ya bansangu ya metabolike. Théorie ya MT ke tuba ti kunwanisa ya ba mbisi ke diaka matiti ya bilanga ke nata bansobolo ya kukonda nzila na kati ya bima ya ke zingaka na nitu, na mutindu yina Hj ke kuma mingi mutindu kidimbu ya kukonda kivuvu ya bansangu ya bima ya ke zingaka na nitu ke kuma mingi mpe ke nata kukabula ya Si na mutindu ya kukonda kukana. Beto me pesa mpe ngindu ya mbandu ya kuvukisa, MT ya mbote, na kati ya yau ba metabolites ya nkaka yina kele na ba ntalu ya ngolo ya kutanina ke kuma mingi mingi (ntalu ya Si ya ngolo), na ntangu yina ya nkaka ke monisa bamvutu ya mpamba-mpamba (ntalu ya Si ya fioti).
Na kusadilaka bantendula ya théorie ya bansangu, beto ketendula théorie ya OD sambu na kutuba na ntwala nde bansoba ya sipesiali yina kekatukaka na bambisi yina kedyaka matiti na kisika mosi ya kesalamaka ve tanata (i) kumata ya bima ya kesimbaka bima (index Si) yina kepusaka bima ya kesimbaka bima (index δj) Kumata ya) bimvuka yankaka ya bima ya sipesiali yina kele ti bima mingi ya ketaninaka ( index) sambu na nsoba ya kukabula mbala ya metabolike na kukabula mingi ya nitu ya leptine. Na nivo ya mvingu ya bantu mosi, kukabula ya Si na ndonga ke vingilama, kisika mvingu ya bantu ke tombula ntalu ya Si na kutadila ntalu ya lutaninu na yandi (Kifwanisu 1B). Na nzila yayi, beto ke tendula théorie ya MT samu na kuzabisa na ntwala ti, kupesa kiese ke nata (i) bansobolo ya kukonda nzila na ba bima yina ke tambulaka na nitu yina ke nata na kukulumuka ya index ya δj, mpe (ii) na kukula ya index ya Hj samu na kukula ya kukonda kivuvu ya bima yina ke tambulaka na nitu. To mambu ya mpamba-mpamba, yina lenda tesama na nzila ya entropie ya Shannon na mutindu ya kuswaswana ya bantu yonso. Na yina metala kimvuka ya bima yina kebasikaka na nitu, théorie ya MT tatubila na ntwala kukabula ya Si na mutindu mosi ya kukonda kukana. Na kutadila nde ba metabolite yankaka kele na nsi ya mambu ya sikisiki na nsi ya mambu ya sikisiki, mpi mambu yankaka kele ve na nsi ya mambu ya sikisiki, mpi valere na bo ya lutaninu ketadila kisika yina bo kezingaka, beto pesaka mpi ngindu ya mbandu ya lutaninu ya kuvukisa, na kati na yo δj mpi Hj kekabulaka na zole na nzila ya Si Kumata na bandambu yonso, kaka bimvuka yankaka ya metabolite ya ngolo tasala Si kukabula (Kifwanisu 1B).
Samu na kumeka nsangu ya théorie ya lutaninu yina ba me balula diaka na zulu ya axis ya théorie ya nsangu, beto me sansa ba lumba ya ba nsusu ya ba nsusu ya bantu ya mayele (Ms) to ya bantu nyonso (Sl) na zulu ya makasa ya Nepenthes pallens (Kifwanisu 2A). Na kusadilaka lusalusu ya MS/MS, beto me baka ba nzila ya MS/MS 599 ya kukonda kuvutukila (dossier ya ba nsangu S1) na ba nzila ya methanol ya ba nsinga ya matiti yina ba me vukisa na manima ya kudia ya ba nsusu. Kusadila ba index ya RDPI, Hj, mpe δj samu na kumona na mabanza mutindu ya kubongisa diaka mambu ya bansangu na ba fichiers ya kubongisa ya MS/MS ke monisa ba mbandu ya kitoko (Kifwanisu 2B). Kutambula ya mvimba kele ti, mutindu me monisama na muntu ke tendulaka bansangu, mutindu ba nsusu ke landa kudia makasa, kitezo ya kubongisa diaka bima nyonso ya nitu ke kuma mingi na ntangu: bangunga 72 na manima ya kudia ya kibulu ke diaka matiti, RDPI ke kuma mingi. Na kufwanisa na luyalu yina me beba ve, Hj me kulumuka mingi, yina me katuka na kiteso ya kuluta mingi ya kuzaba kisalu ya kimuntu ya nitu, yina bo me tanga na nzila ya index δj. Kumonana yayi ke kwenda nzila mosi na ba nsangu ya OD, kansi yau ke kwenda ve na ba nsangu ya nene ya MT, yina ke ndima ti bansobolo ya mpamba (ya kukonda nzila) na ba niveau ya ba metabolites ke sadilamaka mutindu camouflage ya kutanina (Kifwanisu 1B). Ata mambu ya ke basikaka na munoko (OS) mpi bikalulu ya kudia ya bambisi yai zole ya ke diaka matiti kele ya kuswaswana, kudia na bo ya mbala mosi salaka nde bansoba ya mutindu mosi kusalama na nzila ya Hj mpi ya δj na nsungi ya bangunga 24 mpi bangunga 72 ya kukatula bambuma. Luswaswanu mosi kaka me salama na bangunga 72 ya RDPI. Kana beto fwanisa yau na yina me katuka na madia ya Ms, mvingu ya bantu nyonso yina me katuka na madia ya Sl vandaka mingi.
(A) Kusala ya kumeka: ba ngulu ya mpamba (S1) to ba mbisi ya mayele (Ms) ke kudiaka ba matiti ya ba nti ya nzungu yina me katuka na mungwa, na ntangu yina samu na ba mbisi ya ke diaka matiti ya kufwanana, OS ya ba Ms (W + OSMs) ke sadilamaka samu na kusimba mputa ya ba nzila ya matiti ya kufwanana. S1 (W + OSSl) nsusu to masa (W + W). Kutala (C) kele dititi mosi ya kubeba ve. (B) Kukonda kukangama (RDPI na kufwanisa na tablo ya kulandila), mutindu ya kuswaswana (index ya Hj) mpe index ya kuzaba mambu (index ya δj) yina ba me tanga samu na mukanda ya mvingu ya bantu (599 MS/MS; fichier ya ba nsangu S1). Ba mbwetete ke monisa luswaswanu ya nene na kati ya madia ya mbala mosi ya ba mbisi ya ke diaka matiti na kimvuka ya kutala (T-test ya mwana ya nzo-nkanda na t-test zole, *P<0,05 na ***P<0,001). ns, mfunu ve. (C) Index ya kuzenga ntangu ya nene (kesi ya bleu, aside aminé, aside organique mpe sukadi; fichier ya ba nsangu S2) mpe spectre ya bima ya sipesiali (kesi ya mbwaki 443 MS/MS; fichier ya ba nsangu S1) na manima ya kusadila lusadusu ya kufwanisa ya kudia matiti. Bande ya couleur ke tadila 95% ya ntangu ya kutula ntima. Mbwetete ke monisa luswaswanu ya nene na kati ya lusansu ti lusansu [analyse quadratique ya luswaswanu (ANOVA), na nima ya luswaswanu ya mfunu ya masonga ya Tukey (HSD) sambu na kufwanisa mingi ya nima ya ntangu, *P<0,05, **P<0,01 Mpi *** P <0,001]. (D) Kusala mambu ya sipesiali na ba nzila ya kupanzana mpe ba nzila ya sipesiali ya ba metabolite (ba mbandu ya kuvutukila na ba nzila ya kusadila ya kuswaswana).
Samu na kutala kana mvingu ya bantu yina ke kudiaka matiti na nivo ya bima ya kudia ke monanaka na ba nsobolo na nivo ya bima ya kudia ya bibulu mosi mosi, beto tulaka ntete dikebi na bima ya kudia ya bibulu yina beto longukaka ntete na makasa ya Nepenthes pallens yina kele na ngolo ya kukangama na bibulu ya kudia ya bibulu yina me monisama. Ba amide phénoliques kele ba amides phénoliques yina ke vukanaka na ntangu ya kisalu ya kudia matiti ya ba nsusu mpe me zabana na kukulumusa kisalu ya ba nsusu (32). Beto sosaka ba ntuadisi ya MS/MS yina ke wakana mpe beto salaka ba nzila ya ba nzila ya bawu ya kuvukisa (Kifwanisu S1). Yau keyitukisa ve na kumona ti, bima ya kekatukaka na phenol yina kekotaka ve mbala mosi na kutanina nitu na bibulu yina kedyaka matiti, mutindu acide chlorogénique (CGA) mpe rutine, kekulumukaka na manima ya kudya matiti. Na kuswaswana, bambisi yina kedyaka matiti lenda sala nde amide ya phenol kuvanda ngolo mingi. Kulanda kudia ya bambisi zole yina ke diaka matiti ya bilanga vandaka kusala nde bo vanda ti mutindu mosi ya kupesa kikesa na bafenolamide, mpi mutindu yai vandaka kumonana mingi-mingi sambu na de novo synthèse ya bafenolamide. 17-HGL-DTGs, yina ke basisaka ntalu ya mingi ya ba diterpènes acycliques yina kele na bisalu ya mbote ya kufwa ba mbisi ya ke diaka bibulu (33), yina Ms Feeding me monisa mutindu mosi na Sl.
Kifu yina lenda salama na ba eksperiansi ya kudia mbala mosi ya bibulu ke diaka matiti kele luswaswanu na ntalu ya kudia ya matiti na ntangu ya kudia ya bibulu ke diaka matiti, yina ke sala ti yau vwanda mpasi na kukatula ba mpasi ya bibulu ke diaka matiti yina ke katukaka na bamputa mpe bibulu ke diaka matiti. Na kuzaba mbote-mbote kifwani ya bibulu yina ke diaka matiti ya mfinda ya mvutu ya mvingu ya bantu yina me pesa mvutu, beto me landa mutindu ya kudia ya ba lumba ya Ms na Sl na kusadilaka mbala mosi OS yina me katuka kuvukisa (OSM na OSS1) na nzila ya kubula W ya bisika ya matiti yina ke landanaka. Bau ke bokila mutindu yayi lusadusu ya W + OS, mpe yau ke tula na ndonga ya kupesa lusadusu na ntangu ya mbote ya luyantiku ya mvutu yina kibulu ke diaka matiti ke basisa kukonda kunata mambu ya kukangama ya luswaswanu na ntalu to ntalu ya bima yina ke zimbanaka (Kifwanisu 2A) (34). Na kusadilaka nzila ya kufiongunina mpe ya kuzaba MS/MS, beto me baka ba nzila ya MS/MS 443 (fichier ya ba nsangu S1), yina me vukana na ba nzila yina ba me vukisa ntete na ba kumeka ya madia ya mbala mosi. Kufiongunina ya théorie ya bansangu ya kimvuka yayi ya ba nsangu ya MS/MS monisaka ti kubongisa diaka ba metabolomes ya matiti na mutindu ya kufwanisa ba mbisi yina ke diaka matiti ya bilanga monisaka ba nsangu ya OS (Kifwanisu 2C). Na kutuba ya mbote, kana beto fwanisa yo ti lusansu ya OSS1, OSM salaka nde bo kuma ti bikalulu ya mbote na bangunga 4. Yau kele mfunu na kuzaba ti kana beto fwanisa yau na kimvuka ya ba nsangu ya kumeka ya kudia ya mbala mosi ya ba mbisi ya ke diaka matiti, ba nzila ya kusadila yina ke monanaka na kisika ya ba nzila zole na kusadilaka Hj na δj mutindu ba coordonnées mpe nzila ya kimuntu ya metabolome na mvutu ya kusadila ba mbisi ya ke diaka matiti ya kufwanana na ntangu ke kuma mingi na mutindu mosi (Kifwanisu 2D). Na ntangu mosi, beto me tala ntalu ya bima yina kele na kati ya ba acide aminé, ba acide organique mpe ba sukadi (dossier ya ba nsangu S2) samu na kusosa kuzaba kana kukula yayi ya lukanu ya mayele ya bima ya mvingu ya bantu me katuka na kubongisa diaka mvingu ya bantu na kati ya bima ya mvingu ya bantu na mvutu ya ba mbisi ya kudia matiti ya kufwanana ( Kifwanisu S2 ). Sambu na kutendula mbote-mbote mbandu yai, beto landaka diaka mutindu bima yina ke vukisaka nitu ke vukanaka na nzila ya 17-HGL-DTG yina beto tubilaka ntete. Kukota ya OS ya sikisiki ya ba mbisi ya ke diaka matiti ke balukaka na mutindu ya kuyidika diaka mambu ya kuswaswana na kati ya mvingu ya bantu (Kifwanisu S3). Ba amide phénoliques yina kele na bitini ya coumarine mpe ya caféoïle ke pesamaka mingi na OSS1, na ntangu ba OSM ke basisaka nzila mosi ya sikisiki ya ba nsinga ya ke vukisaka ferulyl. Samu na nzila ya 17-HGL-DTG, ba me mona OS ya kuswaswana na nzila ya bima ya mvingu ya bantu mpe ya mvingu ya bantu (Kifwanisu S3).
Na nima, beto longukaka kukangama ya OS na kusadilaka kimvuka ya bansangu ya fioti-fioti yina ke landa ntangu, yina ke landa mutindu ya kusadila ba OSM sambu na kusansa matiti ya matiti ya rosette na bambisi yina ke diaka matiti ya mubisu. Kubaka ba mbandu ke kwendaka nzila mosi ti ba nsangu yina bo sadilaka na kulonguka yai ya ke tadila bima yina ke vandaka na kati ya nitu (35). Na kufwanisa ti mutindu ya kuyidika diaka bima ya nitu yina ke kumaka mingi-mingi na nima ya ntangu, beto ke monaka mutindu mambu ke basikaka na ntangu fioti na matiti ya ke katukaka na Ms, kisika yina mvingu ya bantu (RDPI) mpi mvingu ya bantu (δj) kele na 1 Kuvandaka ti kuyela ya nene na bangunga, mpi mutindu ya kuswaswana (Hj) vandaka kukulumuka mingi na ntangu yai, na BMP1. ya kuzaba kisalu ya kusonika (Kifwanisu S4). Mabuta ya ba gènes ya ke sadisaka na kubalula bima (bonso P450, glycosylférase, mpi BAHD) ke vukanaka na kisalu ya kuvukisa bima ya sipesiali yina ke katukaka na ba unités structurelles yina ke katukaka na bima ya ke sadisaka na kubalula bima ya ntete, na kulandaka mbandu ya ntete ya beto me tubila na zulu. Mutindu ya kulonguka, bo tadilaka nzila ya phenilalanine. Kufiongunina ndimisaka ti ba gènes ya ntete na kati ya mvingu ya bantu ke vuanda na OS mingi na ba mbisi yina ke diaka matiti ya bilanga kana beto fwanisa yau na ba yinti yina ke bendaka ve, mpe ba ke vuanda na nguizani ya ngolo na mutindu ya ku monisa bawu. Facteur ya kusonika MYB8 mpe ba gènes ya ntungulu PAL1, PAL2, C4H mpe 4CL na zulu ya nzila yayi monisaka kubanda ya kusonika na ntwala. Ba nsangu yina ke salaka kisalu na kimvuka ya nsuka ya ba nsangu, mutindu AT1, DH29, mpe CV86, ke monisaka mutindu ya ku pesa nsangu ya zulu na ntangu ya yinda (Kifwanisu S4). Ba mvutu ya beto me tala awa na zulu ke monisa ti kubanda na ntwala ya kuzaba mambu ya transcriptome mpe kutomisa na nima ya kuzaba mambu ya metabolomique kele mutindu mosi ya kuvukisa, yina lenda katuka na ngidika ya kubongisa mambu yina ke banda mvutu ya ngolo ya kuditanina.
Kuyidika diaka na mutindu ya kupesa bidimbu ya ba hormone ya banti ke salaka bonso couche ya ke twadisaka yina ke kotisaka bansangu ya bambisi yina ke diaka matiti sambu na kuyidika diaka fisiolozi ya banti. Na nima ya kulandana ya ba mbisi ya ke diaka matiti, beto me tesaka ngolo ya kuvukisa ya ba ndonga ya ba hormone ya mfunu ya ba nti mpe beto me mona na mabanza mutindu ya ku monisa na ntangu na kati ya bau [Coefficient ya corrélation ya Pearson (PCC)> 0,4] (Kifwanisu 3A). Mutindu beto vandaka kuvingila, ba hormone ya banti yina ke wakana ti biosynthèse ke vukanaka na kati ya réseau ya kumonisa ba hormone ya banti. Na zulu ya mambu yina, bo ke tulaka na karte mambu ya me tala mutindu nitu ke balukaka (index Si) na réseau yai sambu na kumonisa mbote-mbote ba hormone ya banti yina ke katukaka na bankisi ya kuswaswana. Ba nzila zole ya nene ya mvutu ya sikisiki ya ba mbisi ke diaka matiti me bendama: mosi kele na kati ya kimvuka ya JA, kisika JA (mutindu na yandi ya biolozi JA-Ile) na ba bima ya nkaka ya JA ke monisa ntalu ya Si ya kuluta mingi; yankaka kele éthylène (ET). Gibberelin monisaka kaka kukula ya mwa fioti na kimuntu ya kudia matiti, na ntangu yina ba hormone ya nkaka ya ba nti, mutindu cytokinine, auxine, mpe acide abscisique, vandaka na kimuntu ya fioti ya kupesa nzila na bibulu yina ke diaka matiti. Na kufwanisa na kusadila kaka W + W, kukumisa ngolo ntalu ya zulu ya bima ya ke katukaka na JA na nzila ya kisadilu ya OS (W + OS) lenda baluka na kisina na kidimbu ya ngolo ya sikisiki ya ba JA. Na mutindu mosi ya kukonda kuyindula, OSM ti OSS1 yina kele ti bima ya kuswaswana ya ke basisaka me zabana nde yo ke salaka nde JA mpi JA-Ile kuvukana mutindu mosi. Na kuswaswana na OSS1, OSM ke pesamaka na mutindu ya sikisiki mpe na ngolo na ba OSM, na ntangu yina OSS1 ke kumisaka ngolo ve mvutu ya ba mputa ya ntoto (Kifwanisu 3B).
(A) Kufimpa réseau ya co-expression yina me simbama na calcul ya PCC ya simulation ya kinetique ya kuvukisa ba hormone ya ba nti yina ke katukaka na bantu yina ke diaka matiti. Node kemonisaka hormone mosi ya nti, mpi nene ya node kemonisaka index Si ya sikisiki ya hormone ya nti na kati ya bankisi. (B) Kuvukisa ya JA, JA-Ile na ET na matiti yina me katuka na ba nkisi ya kuswaswana yina me monisama na ba langi ya kuswaswana: abricot, W + OSM; mbwaki, W + OSl; ndombe, W + W; gris, C (kuyala) . Ba mbwetete ke monisa luswaswanu ya nene na kati ya lusansu na luyalu (ANOVA ya ba nzila zole na nima ya kufwanisa mingi ya Tukey HSD na nima ya ntangu, *** P <0,001). Kufiongunina ya théorie ya bansangu ya (C)697 MS/MS (fichier ya ba nsangu S1) na biosynthèse ya JA mpe spectre ya kumona ya kubeba (irAOC mpe irCOI1) mpe (D)585 MS/MS (dossier ya ba nsangu S1) na ETR1 na signal ya ET ya kubeba Ba nzila zole ya kusadila ba nzila ya kusadila ba nzila ya kusadila ba mbisi yina ke diaka matiti ya bilanga (plan ya vecule) me basisa. Ba mbwetete ke monisa luswaswanu ya nene na kati ya lusansu ya W+OS mpe luyalu ya kukonda kubeba (ANOVA ya ba nzila zole yina me landa kufwanisa mingi ya Tukey HSD na nima ya ntangu, *P<0,05, **P<0,01 mpe ***P<0,001). (E) Ba graphique ya kupanzana ya kimbeni ya kupanzana ya kisalu ya sipesiali. Ba couleur ke monisa ba gènes ya kuswaswana yina bo me sobaka; bidimbu ke monisa mitindu ya kusansa ya kuswaswana: triangle, W + OSS1; nsuka ya ntoto, W + OSM; serkle C
Na nima, beto ke sadilaka mutindu mosi ya bo me sobaka na mutindu ya genetique (irCOI1 mpi sETR1) na bitambi ya mfunu ya biosynthèse ya JA mpi ya ET (irAOC mpi irACO) mpi mutindu ya kumona mambu (irCOI1 mpi sETR1) sambu na kutadila mutindu ba hormone yai zole ya banti ke balukaka na zulu ya dikabu ya bambisi yina ke diaka matiti ya mpa. Na kulandana na ba kumeka ya ntete, beto ndimisaka kukotisa ba OS ya ba mvingu ya bantu ke diaka matiti na ba yinti ya ke nataka bima ya mpamba (EV) (Kifwanisu 3, C tii na D) mpe kukulumuka ya mvimba ya index ya Hj yina me katuka na OSM, na ntangu yina index ya δj me kuma mingi. Mvutu kele ya kumonana mingi kuluta mvutu yina OSS1 me basisa. Graphique ya ba nzila zole ke sadila Hj na δj mutindu ba coordonnées ke monisa ku katula nsiku ya sikisiki (Kifwanisu 3E). Kutambula ya kuluta pwelele kele ti na ba lumba yina kele na kidimbu ya JA ve, ba nsobolo ya mutindu na mutindu ya metabolome mpe ya kimuntu yina ke katukaka na ba mbisi yina ke diaka matiti ya bilanga ke katukaka pene-pene ya mvimba (Kifwanisu 3C). Na kuswaswana, mutindu ya kumona ET ya pima na ba yinti ya sETR1, ata bupusi ya mvimba na ba nsobolo ya mvingu ya bantu ke diaka matiti kele fioti mingi kuluta yina ya JA ke pesaka bidimbu, ke lembisaka luswaswanu na ba index ya Hj na δj na kati ya ba nsangu ya OSM na OSS1 (Kifwanisu 3D na Kifwanisu S5). . Yau ke monisa ti na nganda ya kisalu ya mfunu ya kupesa bidimbu ya JA, kupesa bidimbu ya ET ke salaka mpe kisalu ya kubongisa mbote-mbote mvutu ya metabolique ya bibulu yina ke diaka matiti. Na kuwakana ti kisalu yai ya kuyidika mambu mbote-mbote, nsoba mosi ve vandaka na mutindu ya kuvukisa bima yonso yina kele na kati ya bambuma ya sETR1. Na ndambu yankaka, kana beto fwanisa yau na ba yinti ya sETR1, ba yinti ya irACO me nata ba ntalu ya mutindu mosi ya mvimba ya ba nsobolo ya mvingu ya bantu yina me katuka na ba mbisi yina ke diaka matiti, kansi yau me monisa ba ntalu ya Hj na δj ya kuswaswana mingi na kati ya ba mpasi ya OSM na OSS1 (Kifwanisu S5).
Na kuzaba ba metabolites ya sipesiali yina kele na makabu ya mfunu na mvutu ya bibulu yina ke diaka matiti mpe kubongisa mbote-mbote mutindu ya kusala yau na nzila ya bidimbu ya ET, beto sadilaka mutindu ya MS/MS ya ntungulu yina ba salaka ntete. Metode yayi me simbama na metode ya kuvukisa bimvuka zole samu na kuvutukila kuzaba dibuta ya bima ya ke sadisaka na nitu na bitini ya MS/MS [produit ya matonsi ya kufwanana (NDP)] mpe ntalu ya kufwanana yina me simbama na kuvidisa ya kukonda mvindu (NL). Ba nsangu ya MS/MS yina ba tungaka na nzila ya kufiongunina ba nzila ya ku balula ya ET me basisa ba nsangu 585 (fichier ya ba nsangu S1), yina ba me manisa na ku vukisa yau na ba modules nsambwadi ya nene ya MS/MS (M) (Kifwanisu 4A) . Bamodule yankaka na kati ya bamodule yai kele ya kufuluka ti bima ya sipesiali yina bo vandaka kusadila ntete: mu mbandu, M1, M2, M3, M4 mpi M7 kele ti bima mingi ya mutindu na mutindu yina kekatukaka na phenol (M1), ba glycoside flavonoïde (M2), ba sukadi ya acyle (M3 Na M4), mpi ba sukadi ya acyl (M3 Na M4), mpi 17-HGL-DTG (M7). Na zulu ya mambu yina, bo ke tangaka bansangu ya siki-siki ya ke tadila bima yina ke balukaka na nitu (index ya Si) ya kima mosi yina ke balukaka na kati ya konso module, mpi bo lenda mona mutindu Si na yo ke kabuanaka na mutindu mosi ya kukonda mindondo. Na bunkufi, ba spectre ya MS/MS yina ke monisaka mutindu ya kudia matiti mingi mpe ya mutindu ya kimuntu ke zabanaka na ba ntalu ya mingi ya Si, mpe ba ntalu ya kurtose ke monisa kukabula ya mika na nsongi ya mukila ya diboko ya kibakala. Mutindu mosi ya kukabula ya ba colloïde ya kukonda mafuta me monana na M1, na kati ya yau amide ya phenol monisaka kitini ya Si ya kuluta mingi (Kifwanisu 4B). 17-HGL-DTG yina beto me tubila na ntwala na M7 monisaka ntalu ya Si ya mwa ngolo, yina ke monisa kiteso ya mwa fioti ya nsiku ya kuswaswana na kati ya mitindu zole ya OS. Na kuswaswana, bima mingi ya bo ke basisaka na mutindu ya sipesiali, mu mbandu rutine, CGA, mpi sukadi ya acyl, kele na kati ya bapoint ya Si ya fioti. Samu na kuzaba mbote mutindu ya kutunga mpe kukabula Si na kati ya bima ya sipesiali, ba tungaka réseau ya ba molecule samu na konso module (Kifwanisu 4B). Kubikula mosi ya mfunu ya théorie ya OD (yina me bongisama na kifwanisu 1B) kele ti kubongisa diaka ba bima ya sipesiali na manima ya kudia matiti ya bilanga fwana kunata bansobolo ya nzila mosi na ba bima yina kele na ntalu ya nene ya kutanina, mingi na ku yika kifwani na bau (na mutindu ya kukabula na mutindu ya kukonda kukana) Mutindu) Bima ya kuditanina yina théorie ya MT me tuba na ntwala. Ba mbuma mingi ya phenol yina me vukana na M1 ke na nguizani na kisalu na kukulumuka ya bisalu ya ba nsusu (32). Na ntangu ya kufwanisa ba ntalu ya Si na kati ya ba mvingu ya bantu ya M1 na kati ya ba matiti ya induit na ba matiti ya ke sala ba nsinga ya kulandila EV na bangunga 24, beto monaka ti kifwani ya mvingu ya bantu mingi na nima ya ba nsusu yina ke diaka matiti kele na nzila ya kukula mingi (Kifwanisu 4C). Kumata ya sikisiki ya ntalu ya Si monanaka kaka na ba phenolamides ya ke taninaka, kansi ata kukula ya ntalu ya Si monanaka ve na ba phenols ya nkaka mpe na ba métabolites ya kuzabana ve yina ke zingaka kintuadi na kati ya module yayi. Yau kele mbandu ya sipesiali, yina kele na nguizani na théorie ya OD. Ba nsangu ya ntete ya ke tadila bansoba ya metabolique yina ke katukaka na bambisi yina ke diaka matiti ke wakana. Na kumeka kana kifwani yayi ya mvingu ya bantu me katuka na ET ya OS, beto me sala kifwanisu ya index ya Si ya mvingu ya bantu mpe me sala ntalu ya mvingu ya bantu na kati ya OSM mpe OSS1 na ba gènes ya EV mpe ya sETR1 (Kifwanisu 4D ). Na sETR1, luswaswanu yina bo ke basisaka na kati ya OSM mpi OSS1 vandaka kukita mingi. Bau sadilaka mpe mutindu ya kuvukisa bimvuka zole na ba nsangu ya MS/MS yina ba vukisaka na ba nsinga yina kele na JA ya kufwana ve samu na kubaka ba modules ya nene ya MS/MS yina me tadila mvingu ya bantu yina ke twadisamaka na JA (Kifwanisu S6).
(A) Ba mvutu ya kuvukisa ya 585 MS/MS yina me simbama na kitini ya kukabula (kufwanana ya NDP) mpe kuvidisa ya kukabula (kufwanana ya NL) ke sala ti module (M) kuvanda na nguizani na dibuta ya kimvuka yina me zabana, to na nzila ya kimvuka ya bima yina me zabana ve to yina me baluka mbote ve. Na lweka ya konso module, bo ke monisa mutindu bo ke kabulaka bima yina ke basikaka na nitu (MS/MS). (B) Réseau moléculaire modulaire: Ba node ke monisa MS/MS na ba nsuka, NDP (mbwaki) na NL (bule) ba ntalu ya MS/MS (kuzenga,> 0,6). Index ya kimuntu ya bima ya ke sadisaka nitu (Si) yina bo me tula mukubu na kutadila module (na diboko ya kimama) mpi yina bo me tula na karte na réseau ya bamolekile (na diboko ya kitata). (C) Module M1 ya yinti ya EV na kifulu ya kutunga (kutala) mpe ya kupesa (kifulu ya kudia matiti ya kufwanana) na bangunga 24: kifwanisu ya réseau moléculaire (ntalu ya Si kele nene ya node, phenolamide ya kutanina me monisama na mbwaki). (D) Kifwanisu ya réseau moléculaire M1 ya nzila ya spectre sETR1 ti EV ti ET ya kukonda ngolo: kimvuka ya phenolic yina bo me monisa na nsinga ya cercle ya vert, mpi luswaswanu ya nene (valeur P) na kati ya bankisi W + OSM mpi W + OSS1 bonso nene ya Nsinga. CP, N-kafeo-tirozine; CS, N-kafeo-kafe; FP, aside ya N-ferulique; FS, N-nsinga ya ntulu; DCS, N’, N”-dicaffeoyl-spermidine; CFS, N’, N”-kafeoyle, feruloyle-spermidine;
Beto me landa diaka kufiongunina banda na genotype mosi ya Nepenthes yina me lemba tii na bimvuka ya bantu ya kimuntu, kisika bansoba ya ngolo na kati ya bimvuka ya bantu yina ke diaka matiti ya bilanga me tubilamaka ntete na bimvuka ya bantu ya kimuntu (26). Sadila kimvuka ya bansangu yai sambu na kutubila ba germe 43. Ba mbuma yai kele ti mitindu 123 ya ba nti yina ke katukaka na N. Ba yinti yayi ba bakaka yau na ba mbutu yina ba vukisaka na bisika ya mutindu na mutindu ya kuzinga ya ba mbuta na Utah, Nevada, Arizona, na Californie (Kifwanisu S7), beto salaka ba nsangu ya mutindu na mutindu ya ba mvingu ya bantu (awa ba ke bokila yau niveau ya bantu) mutindu ya mutindu ya β) mpe mutindu ya kuzaba mambu yina me katuka na OSM. Na kulandana na ba ndombolo ya ntete, beto monaka bansobolo mingi ya mvingu ya bantu na nzila ya ba axes Hj na δj, yina ke monisa ti ba germe kele na ba luswaswanu ya nene na yina me tala plasticité ya ba mvutu ya mvingu ya bantu na ba mbisi yina ke diaka matiti (Kifwanisu S7). Kimvuka yayi ke yibusa beto mambu yina ba monaka na ntwala na yina me tala mutindu ya ngolo ya kusoba ya ba JAs yina ke katukaka na ba mbisi ke diaka matiti, mpe me tanina ntalu ya ngolo mingi na kati ya kimvuka mosi ya bantu (26, 36). Na kusadilaka JA na JA-Ile samu na kumeka nguizani ya nivo ya mvimba na kati ya Hj na δj, beto me mona ti nguizani ya mbote ya nene kele na kati ya JA na index ya mutindu na mutindu ya metabolome β mpe ya kuzaba kisalu (Kifwanisu S7). Yau ke monisa ti, kifu yina me katuka na bibulu yina ke diaka matiti na kati ya ba JA yina me monana na nivo ya bantu lenda katuka na ba polymorphisme ya mfunu ya metabolique yina me katuka na kupona na kati ya bibulu yina ke diaka matiti ya ba insecte.
Ba ndongokolo ya ntete me monisa ti mitindu ya makaya me swaswana mingi na mutindu mpe na mutindu ya kukangama na yina me tala lutaninu ya metabolisme yina me pesamaka mpe yina me salama. Bau ke banza ti bansobolo yayi na yina me tala kupesa bidimbu ya ba nsusu yina ke diaka bibulu mpe ngolo ya kuditanina ke twadisamaka na bupusi ya ba nsusu, luzingu ya ba yinti, mpe ntalu ya bisalu ya kutanina na kisika yina kibulu mosi ke yela. Beto longukaka mutindu ya kuyidika diaka bima ya matiti ya ke katukaka na bibulu yina ke diaka matiti ya mitindu sambanu ya Nicotiana yina ke katukaka na Amerika ya Nordi mpi na Amerika ya Sudi. Bibulu yayi kele na kinkundi na Nepenthes ya Amérique du Nord, nkumbu ya Nicolas Bociflo. La, N. bima ya ke lawusaka, Nikoti n. matiti ya bo me lemba, makaya ya nsinga, makaya ya nsinga (Nicotiana spegazzinii) mpi makaya ya matiti ya makaya (Kifwanisu 5A) (37). Ba mitindu sambanu na kati ya ba mitindu yayi, na kati ya yau mitindu ya N. pardon, kele ba inti ya mvula na mvula ya kimvuka ya ba mbuma ya petunia, mpe ba mbuma ya obtusifolia N. kele ba mbuma ya mvula na mvula ya kimvuka ya mpangi Trigonophyllae (38). Na nima, ba me sala nsangu ya W + W, W + OSM mpe W + OSS1 na ba bibulu yayi nsambwadi samu na kulonguka mutindu ya kubongisa diaka bima ya kudia ya ba nsusu na nivo ya bibulu.
(A) Nti ya filogenetiki ya bo me simba na zulu ya kivuvu ya kuluta mingi [sambu na kusala glutamine ya nikleyere (38)] mpi kukabula ya bisika ya mitindu nsambwadi ya Nicotiana yina kele ti bangwisana ya ngolo (ba langi ya kuswaswana) (37). (B) Kifwanisu ya kupanzana ya mutindu na mutindu ya sipesiali sambu na ba nsangu ya mvingu ya bantu ya mitindu nsambwadi ya Nicotiana (939 MS/MS; fichier ya ba nsangu S1). Na nivo ya bibulu, mutindu ya kuswaswana ya ba metabolome kele na nguizani ya mbote ve na kitezo ya kuzaba kisalu. Kufiongunina ya nguizani na nivo ya ba bibulu na kati ya mutindu ya kusadila bima ya kudia na mutindu ya kuzaba mambu na kuvukisa ya JA me monisama na kifwanisu 2. S9. Kule, mitindu ya kuswaswana; tatu, W + OSS1; nsuka ya ntoto, W + OSM; (C) Ba nsangu ya JA mpe ya JA-Ile me tulama na ndonga na kulandana na ngolo ya OS (ANOVA ya ba nzila zole mpe HSD ya Tukey na nima ya kufwanisa mingi, * P <0,05, ** P <0,01 mpe * ** Samu na kufwanisa W + OS mpe W + W, P <0,001). Kusala nzila ya (D) mutindu na mutindu mpe (E) kimuntu ya konso mutindu na manima ya kufwanisa JA ya bibulu ke diaka matiti mpe ya methyl (MeJA). Mbwetete ke monisa luswaswanu ya nene na kati ya W + OS na W + W to lanolin yika W (Lan + W) to Lan yika MeJA (Lan + MeJa) na luyalu ya Lan (kufiongunina ya mitindu zole ya luswaswanu, na nima ya kufwanisa mingi ya HSD ya Tukey na nima ya ntangu , *P<0,05, **P<0,01 na).
Na kusadilaka mutindu ya kusadila bimvuka zole, beto me zaba ba module 9 ya 939 MS/MS (fichier ya ba nsangu S1). Kubongisa ya MS/MS yina me bongisama diaka na ba nzila ya kusadila ya kuswaswana ke swaswana mingi na kati ya ba modules ya kuswaswana na kati ya ba mitindu (Kifwanisu S8). Kumona na mabanza Hj (yina bo kebingaka awa nde γ-diversité na nivo ya bibulu) mpi δj kemonisa nde bibulu ya kuswaswana kevukanaka na bimvuka ya kuswaswana mpenza na kisika ya kuvukisa bima, kisika kukabwana na nivo ya bibulu kevandaka mbala mingi ya kumonana mingi kuluta kupesa kikesa. Katula N. ligneux na N. obliquus, bau ke monisaka mutindu mingi ya ngolo ya ba mbutu ya ku kotisa (Kifwanisu 5B). Na kuswaswana, bibulu mutindu N. purpurea na N. obtusifolia kele na mvutu ya mvingu ya bantu yina ke monanaka ve mingi na yina me tala lusansu, kansi mvingu ya bantu ke vandaka mingi. Kukabula ya mitindu ya mutindu na mutindu ya mvutu ya mvingu ya bantu yina me pesa nzila na mvingu ya bantu me basisa kuwakana ya yimbi ya nene na kati ya mvingu ya bantu mpe mutindu ya kuswaswana ya ba mvingu ya bantu (PCC = -0,46, P = 4,9×10-8). Ba nsobolo yina OS ke nataka na ba niveau ya ba JAs ke vuanda na nguizani ya mbote na mutindu ya kuzaba mambu ya mvingu ya bantu, mpe ke vuanda na nguizani ya yimbi na mutindu ya kusadila bima ya mvingu ya bantu yina ke monisaka konso mutindu (Kifwanisu 5B mpe Kifwanisu S9). Yau kele mfunu na kuzaba ti, bibulu yina ba ke bokilaka na ndinga ya bantu nyonso mutindu bibulu ya “mvutu ya bidimbu” na kifwanisu 5C, mutindu ba nsusu ya mvingu ya bantu, ba nsusu ya mvingu ya bantu, ba nsusu ya ngolo, mpe ba nsusu ya kulemba, me sala bidimbu ya mfunu na miniti 30. Ba nsangu ya ntama ve ya JA na JA-Ile ya OS, na ntangu yina ba bactérie ya nkaka yina ba ke bokila “ba nsangu ke pesaka ve mvutu”, mutindu ba nzungu ya mvingu ya bantu, ba mfulu ya mvingu ya bantu na N. Na nivo ya mvingu ya bantu, mutindu beto me tubila yau na zulu, samu na Nepenthes ya kulemba, bima yina ke pesaka mvutu na bidimbu monisaka OS ya sikisiki mpe kumisaka mingi δj, na ntangu mosi na kukulumusa Hj. Effet yayi ya ntete ya OS me monana ve na ba bibulu yina me tulama na ndonga ya bibulu yina ke pesa ve mvutu na bidimbu (Kifwanisu 5, D na E). Ba metabolites ya OS ke kabuanaka mingi na kati ya bibulu yina ke pesaka mvutu na bidimbu, mpe bimvuka yayi ya bidimbu ke vukanaka na bibulu yina ke pesaka mvutu ya bidimbu ya kulemba, na ntangu yina bibulu yina ke pesaka mvutu ya bidimbu ya kulemba ke monisaka kukangama fioti (Kifwanisu S8 ). Mvutu yayi ke monisa ti, kukotisa ba JA na mutindu ya OS mpe kubongisa diaka na mutindu ya OS ya metabolome ya ke kulumuka ke vukana na nivo ya bibulu.
Na nima, beto sadilaka pate ya lanoline yina kele na JA ya méthyle (MeJA) samu na kusansa ba yinti samu na kusosa kuzaba kana mitindu yayi ya kukangama kele na bandilu na kuvanda ya JA yina JA ya nganda ke sadilaka, yina ke vuanda na kati ya ba yinti. Kukatula ba estere nswalu kele JA. Beto me mona mutindu mosi ya kusoba malembe-malembe katuka na bibulu yina ke pesaka mvutu na bidimbu tii na bibulu yina ke pesaka ve bidimbu yina ke katukaka na kupesa JA ntangu yonso (Kifwanisu 5, D na E). Na bunkufi, lusansu ya MeJA vutulaka na ngolo yonso baprograme ya bima yina ke vandaka na kati ya ba nsusu ya ke tambulaka na nzila ya nzila mosi, N. obliquus, N. aquatique, N. pallens, mpi N. N. purpurea monisaka kaka kukula ya δj, kansi ve Hj. N. obtusifolia, yina me monisama ntete na kuvukisa ba JA ya fioti kibeni, ke pesa mpe mvutu ya mbote ve na lusansu ya MeJA na yina me tala kubongisa diaka ba mvingu ya bantu. Ba mvutu yayi ke monisa ti, kusalama ya JA to kupesa bidimbu kele na ndilu ya fiziolozi na bibulu yina ke pesaka ve mvutu na bidimbu. Samu na kumeka ngindu yayi, beto me longuka ba mitindu iya (N. pallens, N. mills, N. rose mpe N. microphylla) yina me katuka na W + W, W + OSMs mpe W + OSS1 Transcriptome (39). Na kulandana na mutindu ya kubongisa diaka bima ya mvingu ya bantu, ba mvingu ya bantu me kabuana mbote na kifulu ya mvingu ya bantu, na kati ya yau N. ya kulemba monisaka RDPI ya kuluta mingi yina me katuka na OS, na ntangu yina N. gracilis vandaka na fioti (Kifwanisu 6A). Kasi, ba me mona ti mutindu ya kuswaswana ya ba nsangu yina N. oblonga me nata kele fioti na kati ya ba mitindu iya, na kuswaswana na mutindu ya kuswaswana ya ba nsangu ya N. oblonga yina ba monisaka ntete na ba mitindu nsambwadi. Ba ndombolo ya ntete me monisa ti kimvuka ya ba gènes yina ke tadila ba nsangu ya ntete ya kutanina, na kati na yau ba nsangu ya JA, ke tendula mutindu ya sikisiki ya ba mvutu ya ntete ya kutanina yina ke katukaka na ba éliciteurs yina ke tadila ba mbisi ya ke diaka matiti na mitindu ya Nicotiana (39). Kufwanisa ba nzila ya kupesa bidimbu ya JA na kati ya bibulu iya yayi monisaka mutindu mosi ya kitoko (Kifwanisu 6B). Ba gènes mingi na nzila yayi, mutindu AOC, OPR3, ACX mpe COI1, monisaka kitezo ya fioti ya kukota na ba bibulu iya yayi. Kasi, gène mosi ya mfunu, JAR4, ke balulaka JA na mutindu na yandi ya biolozi ya ba nsangu ya kuvukisa ya JA-Ile, mpe kitezo ya yandi ya kusonika kele fioti mingi, mingi na ba N. Diaka, bo monaka ve kaka mambu yina bo sonikaka na zulu ya gène ya nkaka AOS na N. Ba nsobolo yayi na yina me tala ba gènes lenda vanda na kikuma ya ba nsangu ya kulutila yina me katuka na kubasika ya fioti ya JA na ba nyama yina kele na bidimbu ya kukonda ngolo mpe kubasika ya N. gracilis.
(A) Kufiongunina théorie ya bansangu ya kubongisa diaka bamvutu ya ntete ya kusonika ya mitindu iya ya makaya yina kele na kuwakana ya ngolo yina bo bakaka na nima ya minuta 30 na nima ya kukotisa bambisi yina ke diaka matiti. Bau ketangaka RDPI na kufwanisa makasa yina kekatukaka na OS ya bambisi yina kedyaka matiti na yina metala mputa. Ba couleur ke monisa mitindu ya kuswaswana, mpi bidimbu ke monisa mitindu ya kuswaswana ya kusansa. (B) Kutadila mutindu ba gène ke basikaka na banzila yina ke pesaka bidimbu ya JA na kati ya bambisi iya. Nzila ya JA ya petepete ke monisama na lweka ya plot ya kesi ya. Ba couleur ya kuswaswana ke monisa mitindu ya kuswaswana ya kusadila. Mbwetete ke monisa ti luswaswanu ya nene kele na kati ya lusansu ya W + OS na lusansu ya W + W (sambu na t-test ya Mulonguki samu na luswaswanu ya ba nkwelani, *P<0,05, **P<0,01 na ***P<0,001). OPDA, aside ya 12 ya ke vandaka na kati ya bambuma; OPC-8: 0,3-oxo-2(2′(Z)-pentenyl)-cyclopentane-1-aside octanoïque.
Na kitini ya nsuka, beto longukaka mutindu ya kuyidika diaka metabolome ya mitindu ya kuswaswana ya banti lenda kangama na bambisi yina ke diaka matiti. Bansosa ya ntama vandaka kutubila mingi mutindu ya Nicotiana. Kutelemina na bau na Ms na ba nsusu ke swaswana mingi (40). Awa, beto longukaka kuwakana na kati ya mbandu yai ti ngolo na bo ya kubalula bima. Na kusadilaka mitindu iya ya makaya yina beto me tubila na zulu, mpe kumeka nguizani na kati ya mutindu na mutindu mpe mutindu ya kuzaba kisalu ya metabolome yina ke katukaka na ba mbisi yina ke diaka matiti mpe ngolo ya ba yinti na Ms mpe Sl, beto me mona mutindu ya kutelemina, mutindu na mutindu mpe mutindu ya kuzaba kisalu na generaliste Sl Bau nyonso kele na nguizani ya mbote, na ntangu yina nguizani na kati ya mutindu ya kuswaswana ya mfunu kele ve na Fig. 10). Na yina me tala mvingu ya bantu na S1, ba N. chinensis mpe N. gracilis yina me lemba, yina ba monisaka ntete ti ba ke monisaka ba nivo ya ku balula bidimbu ya JA mpe ba mvingu ya bantu, vuandaka na bamvutu ya kuswaswana mingi na yina me tala mvingu ya bantu ke diaka matiti, mpe ba monisaka mpe mvingu ya ngolo ya mutindu mosi. Kuvukisa nitu.
Na bamvula makumi sambanu me luta, théorie ya lutaninu ya ba yinti me pesa nzila ya théorie, yina bantu ya ke salaka bansosa me tuba na ntwala ntalu ya nene ya evolisio mpe bisalu ya ba metabolites ya ba yinti ya sipesiali. Mingi na kati ya malongi yai ke landaka ve mutindu ya mbote ya kubaka bangindu ya ngolo (41). Bau ke pesa bangindu ya mfunu (3) na nivo mosi ya analyse. Kana kumeka ya ba nsangu ya mfunu ke pesa nzila na kufiongunina ba théorie ya sikisiki, yau ta sala ti Kisalu ke kwenda na ntwala. Beno pesa maboko, kansi beno buya bantu ya nkaka (42). Na kisika na yau, théorie ya mpa ke sala ba nsangu na ba niveau ya kuswaswana ya analyse mpe ke yika couche ya mpa ya ba ngindu ya kutendula (42). Kasi, ba théorie zole yina ba me pesa na niveau ya kisalu, MT mpe OD, lenda kutendulama na pete mutindu ba nsangu ya mfunu ya ba nsobolo ya sipesiali ya bima ya kudia yina ke katukaka na ba mbisi yina ke diaka matiti: théorie ya OD ke ndima ti bansobolo na “kisika” ya sipesiali ya bima ya kudia ke na nzila mingi . Théorie ya MT ke ndima ti bansobolo yayi ke vuanda na nzila ve mpe ke vuanda na mutindu mosi na kifulu ya mvingu ya bantu, mpe ke vuanda na kifu ya kuvwanda na bima ya mvingu ya bantu yina kele na mfunu mingi ya kutanina. Ba ekzame ya ntete ya ba nsangu ya OD mpe MT me mekamaka na kusadilaka kimvuka ya fioti ya bima ya “kutanina” ya a priori. Ba nsinsani yayi ya ke tala mambu ya bima ya ke tambulaka na nitu ke kanga nzila na ngolo ya kufiongunina kitezo mpe nzila ya kubongisa diaka bima ya nitu na ntangu ya kudia matiti, mpe ke pesa ve nzila na kumeka na kati ya nzila ya ntalu ya kufwanana samu na kulomba ba nsangu ya mfunu yina lenda kutadilama na kimvuka Kuzaba ntalu ya ba nsobolo na bima ya nitu ya ba yinti. Awa, beto sadilaka tekiniki ya mpa na mambu ya mvingu ya bantu yina me simbama na MS ya ordinatere mpe beto salaka lusalusu ya MS ya mvingu ya bantu na mbongo ya mvimba ya ba ntendula ya théorie ya bansangu samu na kumeka luswaswanu na kati ya ba mambu zole yina ba me pesa na nivo ya mvingu ya bantu na yinza ya muvimba. Kubikula ya mfunu ya théorie yai. Bau me sadila théorie ya ba nsangu na mambu mingi, mingi na yina me tala bansosa ya bibulu na mutindu ya kutambula ya madia (43). Kasi, mutindu beto me zaba, yayi kele kisadilu ya ntete yina ba ke sadilaka samu na kutendula kisika ya bansangu ya mvingu ya bantu ya ba yinti mpe kumanisa ba mambu ya ekolozi yina me tala ba nsobolo ya mvingu ya bantu ya ntangu fioti na mvutu ya ba nsangu ya nzingulu. Mingimingi, ngolo ya mutindu yayi kele na ngolo na yau ya kufwanisa ba mbandu na kati mpe na kati ya mitindu ya ba yinti samu na kutala mutindu ba mbisi ke diaka matiti me katuka na mitindu ya kuswaswana na mutindu ya kukula ya nene na kati ya ba mitindu na ba nivo ya kuswaswana ya ntungulu. Kubalula bima na nitu.
Kufiongunina ya bima ya mfunu (PCA) ke balulaka kimvuka ya bansangu ya ba nzila mingi na kifulu ya kukulumusa kitezo na mpila nde nzila ya nene ya bansangu lenda kutendula, yau yina yau ke sadilamaka mingi mutindu tekiniki ya kusosa sambu na kufiongunina kimvuka ya bansangu, mutindu metabolome ya kukonda kukangama. Kasi, kufiongunina kitezo ke zimbisa ndambu ya bansangu yina kele na kati ya ba nsangu, mpe PCA lenda ve kupesa bansangu ya ntalu na yina me tala bifu yina kele na mfunu mingi na théorie ya écologie, mutindu: mutindu ba mbizi ke diaka matiti ke yidika diaka mutindu na mutindu na bisika ya sipesiali (mu mbandu, kimvwama, kukabula) Na bunene) ya ba metabolites? Inki bima ya ke sadisaka na nitu ke tubaka na ntwala mambu yina ke salamaka na nitu ya muntu mosi ya ke diaka matiti ya mubisu? Na kutalaka mambu ya sikisiki, ya kuswaswana mpe ya kukonda kukangama, bansangu ya kele na kati ya profil ya metabolite ya sikisiki ya matiti ke bebaka, mpe yau ke monanaka ti kudya ba mbisi yina ke diaka matiti ya bilanga lenda sala ti ba nsangu ya sikisiki ya matiti kusala. Na kukonda kuyindula, beto monaka ti, mutindu ba me tubila yau na ba nzimbu ya théorie ya ba nsangu yina ba me sadila, mambu ya metabolique yina ke basikaka kele na nguizani ya nene na manima ya mvita ya ba mbisi zole yina ke diaka matiti (Sl yina ke kudiaka na mpimpa) mpe M. muntu ya mayele ya Solanaceae. Kuyantika ya aside ya mafuta (FAC) na OS (31). Na kusadilaka OS ya bambisi yina kedyaka matiti sambu na kusansa bamputa ya kutobula yina bo metulaka bansiku, lusansu ya bambisi yina kedyaka matiti yina bo mefwanisa kumonisaka mpi mambu ya mutindu mosi. Nzila yayi ya kufwanana samu na kufwanisa mutindu ba yinti ke pesaka mvutu na ba nwanisu ya ba mbisi yina ke diaka matiti ke katulaka mambu yina ke pesaka boma yina ke katukaka na ba nsobolo ya bikalulu ya kudia ya ba mbisi yina ke diaka matiti, yina ke nataka ba mpasi ya mutindu na mutindu na ba ntangu ya kuswaswana (34). FAC, yina me zabana nde yo kele kikuma ya nene ya OSM, ke kulumusaka JAS mpi bamvutu ya nkaka ya ba hormone ya banti na OSS1, kansi OSS1 ke kulumusaka mbala nkama (31). Kansi, OSS1 salaka nde JA kuvukana kiteso mosi kana beto fwanisa yo ti OSM. Yau me monisama ntete ti mvutu ya JA na Nepenthes ya kulemba ke pesa mpasi mingi na OSM, kisika FAC lenda tanina kisalu na yau ata kana yau me fuluka na masa na kitezo ya 1:1000 (44). Na yina, kana beto fwanisa yau na OSM, ata FAC na OSS1 kele fioti mingi, yau me lunga na kubasisa JA ya kufwana. Ba ndombolo ya ntete me monisa ti ba proteine yina kele mutindu ba porine (45) mpe ba oligosaccharides (46) lenda kusadila mutindu ba nzila ya ku pesa nzila na ba mvutu ya ku tanina ba yinti na OSS1. Kasi, yau kele kaka ya kuzaba ve kana ba éliciteurs yayi na OSS1 kele na kisina ya kuvukisa ya JA yina me monana na kulonguka ya ntangu yayi.
Ata ba ndombolo kele fioti yina ke tendula ba nzila ya misapi ya kuswaswana ya mvingu ya bantu yina ke katukaka na kusadila ba mvingu ya bantu ya mutindu na mutindu to JA to SA ya nganda (acide salicylique) (47), muntu mosi ve me bebisa mvingu ya bantu ke diaka mvingu ya bantu na mutindu mosi na réseau ya matiti ya ba yinti mpe bupusi na yau na mvingu ya bantu na nzila ya mvingu ya bantu. bansangu ya muntu yandi mosi. Kufiongunina yai ndimisaka diaka nde kuwakana ya réseau ya ba hormone ya kati ti ba hormone ya nkaka ya banti yina kele ve ba JA ke yidikaka mutindu ya kuyidika diaka bima ya nitu yina ke katukaka na bambisi yina ke diaka matiti. Mingimingi, beto monaka nde ET yina OSM salaka vandaka mingi kuluta yina OSS1 salaka. Mutindu yayi ke kwenda nzila mosi na mambu mingi ya FAC na OSM, yina kele kikalulu ya mfunu mpe ya kufwana samu na kupesa nzila na kupasuka ya ET (48). Na yina me tala ngwisani na kati ya ba yinti na ba mbisi ke diaka matiti, kisalu ya kupesa bidimbu ya ET na yina me tala mvingu ya bima ya ke sadisaka na nitu ya ba yinti kele kaka na bisika fioti mpe yau ke tala kaka kimvuka mosi ya bima. Na zulu ya mambu yina, ba ndombolo mingi me sadila kusadila ET na nganda to ba ntuadisi na yau to ba inhibiteurs ya mutindu na mutindu samu na kulonguka mutindu ya kubongisa ET, na kati ya yau bisadilu yayi ya kimunganga ya nganda ke buta ba mpasi mingi ya kukonda sikisiki. Na kuzaba na beto, kulonguka yayi ke monisa lusalusu ya ntete ya nene ya mvingu ya bantu na yina me tala kisalu ya ET na kusadila ET samu na kubasisa mpe kubakisa ba yinti ya transgénique yina kele na kifu samu na kubongisa ngolo ya metabolome ya ba yinti. Kukotisa ET ya sikisiki ya bambisi yina kedyaka matiti lenda nsuka-nsuka kusoba mvutu ya metabolome. Kima ya kuluta mfunu kele kusadila ba gènes ya ET (ACO) mpe ya kuzaba mambu (ETR1) yina monisaka mutindu ya kuvukisa ba gènes ya ba phenolamides yina kele na ba nyama yina ke diaka matiti ya bilanga. Yau memonisama ntete nde ET lenda yidika mbote-mbote mutindu JA kevukisaka nicotine na kuyidikaka mutindu yina bo ketulaka bima yina kekatukaka na nitu ( 49 ). Kansi, kana beto tadila mambu na mutindu ya mekanika, yo kele pwelele ve mutindu ET ke yidikaka mbote-mbote mutindu bo ke kotisaka phenamide. Na zulu ya kisalu ya kupesa bidimbu ya ET, bo lenda balula mpi masa yina ke basikaka na nitu sambu na kuyidika mbongo yina bo ke tulaka na ba amide ya polyaminophénol. S-adénosyl-1-méthionine kele ET mpi Nzila ya kati-kati ya nzila ya kusala bima ya ke sadisaka na nitu. Mutindu yina kidimbu ya ET ke twadisaka kiteso ya phenolamide ke lombaka kulonguka mambu mingi.
Na ntangu ya nda, samu na ntalu ya mingi ya ba metabolites ya sipesiali ya mutindu ya kuzabana ve, dikebi ya ngolo na ba ndonga ya sikisiki ya bima ya nitu me kuka ve kutadila mbote-mbote bansobolo ya ntangu ya mutindu ya bima ya nitu na nima ya bisalu ya biolozi. Na ntangu yayi, na kutalaka lusalusu ya théorie ya ba nsangu, mbutu ya ntete ya kuzwa spectre ya MS/MS na kutalaka ba mvingu ya bantu yina ke diaka to ke landa ba mvingu ya bantu ke landa ku kulumusa mutindu ya mvingu ya bantu ya mvingu ya bantu na ntangu mosi na ku tombula kitezo ya kimuntu na yandi. Kuyela yai ya ntangu fyoti ya kimuntu ya metabolome yina kekatukaka na bambisi yina kedyaka matiti kewakanaka ti kuyela ya ngolo ya kimuntu ya transcriptome. Kikalulu yina ke sadisaka mingi na kuzaba kisalu yai ya nene ya metabolome (yina kele ti ntalu ya Si ya mingi) kele kima mosi ya sipesiali yina kele ti kisalu ya kudia matiti yina bo vandaka kuzaba ntete. Mutindu yayi ke kwenda nzila mosi na mambu yina ba me tuba na ntwala ya théorie ya OD, kansi mambu yina ba me tuba na ntwala ya MT yina me tala mambu ya kukonda kukana yina ba ke salaka na nzila ya metabolome ke wakana ve. Kasi, bansangu yayi ke kwenda mpe nzila mosi na mambu yina ba me tuba na ntwala ya modele ya kuvukisa (MT ya mbote; Kifwanisu 1B), samu ti ba metabolites ya nkaka yina kele na bifu ve yina kele na bisalu ya kutanina yina me zabana ve lenda landa kaka kukabula ya Si na mutindu ya kukonda kukana.
Mutindu mosi ya mfunu yina bansosa yayi me baka diaka kele ti, banda na nivo ya evolisio ya fioti (kimvuka ya nti mosi mpe ya makaya) ti na kitezo ya nene ya evolisio (mingi ya makaya yina kele na nguizani ya ngolo), ba nivo ya kuswaswana ya kimvuka ya evolisio kele na “lutaninu ya mbote” Kuvanda na luswaswanu ya nene na makuki ya bibulu yina ke diaka matiti. Moore mpi bankaka. (20) mpe Kessler na Kalske (1) na kimpwanza nyonso ba pesaka dibanza ya kubalula ba niveau tatu ya bisalu ya bibulu yina Whittaker (50) swaswanisaka na luyantiku na ba nsobolo ya ntangu ya kutunga mpe ya kupesa nzila na bibulu ya kimunganga; bansoniki yayi mpe me sala ve na bunkufi Ba nzila ya kuzwa bansangu ya metabolome na kitezo ya nene mpe ke monisa ve mutindu ya kuzaba mutindu ya kuswaswana ya metabolime na ba nsangu yayi. Na kulonguka yayi, bansobolo ya fioti na ndonga ya bisalu ya Whittaker ke tadila mutindu ya kuswaswana ya α-metabolisme mutindu mutindu ya kuswaswana ya ba spectre ya MS/MS na kati ya yinti mosi, mpe mutindu ya kuswaswana ya β-metabolisme mutindu mutindu ya kuswaswana ya bima ya nitu ya kimvuka mosi ya bantu Kisika, mpe mutindu ya kuswaswana ya γ-metabolisme ke vuanda kulandana ya mutindu mosi ya analysis.
Signal ya JA kele mfunu samu na ba mvutu ya mutindu na mutindu ya bima ya kudia ya bibulu. Na yau, yau kele na kukonda ya kumeka ya ngolo ya ntalu ya dikabu ya nsikudukusu ya kati ya ba biosynthèse ya JA na mutindu ya kuswaswana ya bima ya nitu, mpe kana kidimbu ya JA kele kisika ya mvimba samu na mutindu ya kuswaswana ya bima ya nitu yina ke katukaka na mpasi na kitezo ya nene ya mvingu ya bantu, yau kele kaka mpasi na kuzaba. Beto me mona ti kimuntu ya kudia matiti ya Nepenthes ke nataka kuzaba mambu ya mvingu ya bantu mpe kusoba ya kuzaba mambu ya mvingu ya bantu na kati ya kimvuka ya ba nsusu ya Nicotiana mpe na kati ya ba nsusu ya Nicotiana yina kele na nguizani ya mbote na mutindu mosi ya kusungama na kupesa bidimbu ya JA. Na zulu ya yau, kana kidimbu ya JA me beba, kimuntu ya mvingu ya bantu yina ke katukaka na genotype mosi ya ke diaka matiti ke katuka (Kifwanisu 3, C mpe E). Sambu bansoba ya spectre ya mvingu ya bantu ya Nepenthes yina me lemba na mutindu ya kimuntu kele mingi-mingi ya ntalu, bansoba ya mutindu na mutindu ya mvingu ya bantu β mpe ya sikisiki na lusalusu yayi lenda katuka mingi na nsangu ya ngolo ya ba ndonga ya bima ya mvingu ya bantu yina kele na bima mingi ya mvingu ya bantu. Ba classe yayi ya kimvuka ke yala kitini ya mvingu ya bantu mpe ke nata nguizani ya mbote na ba nsangu ya JA.
Sambu ba nzila ya biochimie ya mitindu ya makaya yina kele pene-pene na yau me swaswana mingi, ba metabolites ke zabanaka na sikisiki na yina me tala kikalulu, yau yina yau ke vandaka ya kufimpa mingi. Kusadila ya théorie ya bansangu ya profil ya metabolique yina me kangama ke monisa ti kukotisa bima ya ke diaka matiti ya bilanga ke kumisaka ngolo mvingu ya bantu na kati ya mutindu ya metabolique ya gamma mpe kuzaba kisalu. Signal ya JA ke sala kisalu ya nene na kuwakana yai. Kuyela ya kimuntu ya metabolome ke wakana ti nsangu ya nene ya OD mpi yo ke vandaka na kuwakana ya mbote ti kidimbu ya JA, kansi kidimbu ya JA ke vandaka na kuwakana ya mbi ti mutindu ya kuswaswana ya gamma ya metabolike. Ba mbandu yayi ke monisa ti ngolo ya OD ya ba yinti ke talanaka mingi na plastisite ya JA, ata na kitezo ya fioti to na kitezo ya nene ya kukula. Ba eksperiansi ya kusadila JA ya nganda yina ke buyaka bifu ya biosynthèse ya JA ke monisa diaka ti mitindu ya makaya yina kele na nguizani ya mbote lenda kuswaswana na mitindu yina ke pesaka mvutu na bidimbu mpe yina ke pesaka ve mvutu na bidimbu, kaka mutindu mutindu na bau ya JA mpe plastique ya metabolome yina ke katukaka na bibulu yina ke diaka matiti. Ba bibulu yina ke pesaka ve mvutu na bidimbu lenda pesa mvutu ve samu na kukonda ngolo na bau ya kubasisa JA ya kati mpe yau yina bau ke vandaka na bandilu ya fiziolozi. Yau lenda salama na ba nsobolo na ba gènes yankaka ya mfunu na nzila ya JA ya kupesa bidimbu (AOS mpe JAR4 na N. crescens) ya. Mvutu yai kemonisa nde mitindu yai ya nene ya evolisio ya kati ya bambisi lenda katuka mingimingi na bansoba yina kesalamaka na mutindu ya kumona mpi ya kupesa mvutu na ba hormone ya kati.
Na zulu ya nguizani na kati ya ba yinti na ba mbisi ke diaka matiti ya bilanga, kusosa mutindu ya kuswaswana ya bima ya kudia ke na nguizani na ba nsangu nyonso ya mfunu ya théorie na kusosa ya kufwanana ya biolozi na kizunga mpe ntungulu ya bifu ya mpasi ya phenotypique. Na kukula ya ntalu ya bansangu yina bisadilu ya MS ya bilumbu yayi me baka, kumeka ya ba hypothèses na yina me tala mutindu ya kuswaswana ya bima ya ke sadisaka nitu lenda kuluta ntangu yayi luswaswanu ya bima ya nitu ya muntu na muntu/ya kimvuka mpe kusala bansosa ya yinza ya muvimba samu na kumonisa mutindu ya kusadila yina muntu lenda vingila ve. Na nzila ya kufiongunina na kitezo ya nene, kingana mosi ya mfunu kele ngindu ya kuyindula ba karte ya mfunu yina lenda salama samu na kusosa bansangu. Na yina, mbutu mosi ya mfunu ya kuvukisa ya ntangu yayi ya mvingu ya bantu ya MS/MS ya kukonda luvunu mpe théorie ya bansangu kele ti yau ke pesa nzila ya pete yina lenda salama samu na kutunga ba karte samu na kutala mutindu ya mvingu ya bantu na ba nsinsani ya kuswaswana ya mvingu ya bantu. Yo kele kima ya mfunu ya bo kelombaka na metode yai. Kulonguka ya ntungulu ya fioti/ya nene na ekolozi ya kimvuka.
Na niveau ya ntungulu ya nene, ntuala ya théorie ya ntungulu ya ntungulu ya ba yinti na ba nsusu ya Ehrlich na Raven (51) kele ya ku tuba na ntwala ti nsobolo ya mutindu ya ku tambula na kati ya ba bibulu kele kikuma ya ku swaswana ya ba ndonga ya ba yinti. Kansi, na bamvula makumi tanu banda kubasika ya mukanda yayi ya mbutu, ba me meka ve mingi ngindu yayi (52). Yau ke katukaka mingi na bifu ya phylogenetique ya bifu ya metabolique ya kufwanana na kati ya ba ndonga ya ba yinti ya ntama. Rareté lenda salama sambu na kukanga bametode ya kufimpa mambu ya bo kekana. Kutambula ya kisalu ya MS/MS ya ntangu yayi yina ke salama na nzila ya théorie ya ba nsangu ke pesa ntalu ya mutindu mosi ya ntungulu ya MS/MS ya ba ntungulu ya ba ntungulu yina me zabana ve (kukonda kupona ba ntungulu na ntwala) mpe ke balula ba MS/MS yayi na kimvuka ya MS/MS, mutindu yina na ntungulu ya bisalu Ba mbandu yayi ya ntungulu ya nene ke fwanana na kitezo ya ku tula na ndonga. Bidimbu ya pete ya statistique. Nzila kele mutindu mosi na kufiongunina phylogenetique, yina lenda sadila ndonga ya ndonga samu na kuzaba ntalu ya mutindu na mutindu to ntungulu ya bifu kukonda kuzaba na ntwala.
Na nivo ya biochimie, hypothèse ya kufiongunina ya Firn na Jones (53) ke monisa ti mutindu ya kuswaswana ya bima ya ke sadisaka na nitu ke taninama na nivo ya kuswaswana samu na kupesa bima ya ntete samu na kusala bisalu ya biolozi ya bima yina ke sadisaka na nitu yina vuandaka ntete ve na nguizani to yina vuandaka na kifulu na yau. Ba nzila ya théorie ya ba nsangu ke pesa nzila na kati ya yau ba nsobolo yayi ya ntungulu ya bima ya ke salamaka na nitu yina ke salamaka na ntangu ya kuzaba mbote-mbote bima ya nitu lenda kutangama mutindu kitini ya nzila ya kuzaba ntungulu yina ba me pesa: kuyikama ya biolozi ya ngolo katuka na ntungulu ya fioti tii na ntungulu ya nene Kukangama ya ntungulu ya kisika mosi buna.
Na kimvuka, na bilumbu ya ntete ya biolozi ya ba molecule, ba théorie ya mfunu ya kutanina ba yinti salamaka, mpe ba nzila ya kubaka bangindu yina ke katukaka na ba ngindu ke monanaka mingi mutindu nzila mosi kaka ya kukwenda na ntwala ya siansi. Yau kekatukaka mingi na bandilu ya teknike ya kutesa metabolome ya mvimba. Ata ba nzila ya kutambula na ba ngindu kele mfunu mingi na kupona ba nzila ya nkaka ya kikuma, ngolo na bau ya ku kwenda na ntwala na kubakisa na beto ya ba réseaux biochimiques kele fioti kuluta ba nzila ya ordinatere yina kele na ntangu yayi na siansi ya bilumbu yayi yina ke lombaka bansangu mingi. Na yina, ba théorie yina lenda ve kuzaba na ntwala kele ntama na zulu ya ba nsangu yina kele, na yina formule/cycle ya kumeka ya hypothétique ya kukwenda na ntwala na kitini ya kusosa lenda kukatuka ve (4). Beto ke mona na ntwala nde mutindu ya kusala kisalu ya ordinatere ya metabolomique yina bo me kotisa awa lenda vutula mpusa ya mambu ya ntama ve (inki mutindu) mpi ya nsuka (sambu na nki) ya kuswaswana ya bima yina ke balukaka na nitu, mpi kupesa maboko na nsungi ya mpa ya siansi ya bansangu yina ke twadisamaka na théorie. Nsungi yina tadilaka diaka malongi ya mfunu yina pesaka bandonga ya bantu ya ntama kikesa.
Kudia ya mbala mosi ya ba mbisi ke diaka matiti ya bilanga ke salama na ku sansa nsusu ya instar ya zole to nsusu ya Sl na zulu ya dititi mosi ya nti ya nzungu ya langi ya mpembe ya nti mosi ya ke basisaka bintuntu ya rose, na ba nsusu 10 ya ke vutukilaka na konso nti. Bau vandaka kukanga ba larve ya ba insecte na ba pense, mpe bau vandaka kuvukisa mikanda ya matiti yina kubikalaka bangunga 24 mpe 72 na manima ya kuzwa kimbefo mpe kutula yau nswalu na congelateur, mpe bau vandaka kukatula ba metabolites.
Kulanda lusansu ya bambisi ya ke diaka matiti na mutindu mosi ya ke wakana mingi. Metode kele ya kusadila ba roues ya modele ya lele sambu na kutobula ba ndonga tatu ya bansende na konso ndambu ya kati-kati ya matiti tatu ya nti yina me panzana mbote-mbote na ntangu ya kuyela ya nsinga ya lele, mpi kutula mbala mosi 1:5 Dilué Ms. To kusadila misapi ya kele ti baganto sambu na kukotisa S1 OS na kati ya nsinga ya kutobula. Kukatula mpe kusadila lukaya mutindu beto me tubila yau na zulu. Sadila mutindu yina beto me tubila na ntwala sambu na kubasisa bima ya ntete-ntete yina ke sadisaka na nitu mpi ba hormone ya banti (54).
Samu na kusadila JA ya nganda, ba nsinga ya tatu ya konso nsinga ya rose sambanu ya konso mutindu ke sadilamaka na 20μl ya pate ya lanoline yina kele na 150μg ya MeJA (Lan + MeJA), mpe 20μl ya lanoline plus nkisi ya kukanga mputa (Lan + W), to kusadila a μl ya mputa (Lan + W). Bo vandaka kukatula matiti ya nti bangunga 72 na nima ya kusala yo nkisi, bo vandaka kutula yo na zulu ya azote ya masa, mpi bo vandaka kubumba yo na -80°C tii kuna bo ta sadila yo.
Ba nzila iya ya JA na ET ya ku balula ba gènes, disongidila irAOC (36), irCOI1 (55), irACO (48), me zabana na kimvuka na beto ya bansosa. irAOC monisaka ngolo kukulumuka ya JA na JA-Ile, na ntangu yina irCOI1 vandaka ve na mpasi na ba JA. Kana beto fwanisa yo ti EV, kimvuka ya JA-Ile kumaka mingi. Mutindu mosi, irACO ta kulumusa ntalu ya ET, mpi kana beto fwanisa yo ti EV, sETR1, yina ke waka ve ET, ta sala nde ET kubasika mingi.
Bau kesadilaka spectromètre ya laser ya kekatukaka na ntangu ya kyeleka sambu na kusala kitesilu ya ET kukonda kukangama. Mbala na nima ya kusadila nkisi, bo vandaka kuzenga ndambu ya makasa mpi kutula yo na dilonga ya ditensi ya 4 ml ya kukangama, mpi bo vandaka kubika kisika ya ntu na kuvukana na nsungi ya bangunga 5. Na ntangu ya kutesa, konso fioti-fioti vandaka kuyobila na masa ya mupepe ya bunkete ya ba litre 2/heure na nsungi ya miniti 8, yina vandaka kuluta ntete na nzila ya kima mosi ya ke sadisaka na kubasisa CO2 ti masa.
Ba nsangu ya ba nsangu ya fioti-fioti basikaka na luyantiku na (35) mpe ba bumbaka yau na kisika ya kubumba bansangu ya mvimba ya ba gènes (nimero ya kukota GSE30287). Ba nsangu yina ke wakana na ba matiti yina me katuka na lusansu ya W + OSMs mpe na luyalu yina me beba ve, ba me katula yau samu na kulonguka yayi. Kuluta ngolo kele log2. Na ntwala ya kusala bansosa ya ba ntalu, ba balulaka nzila ya luyantiku mpe ba tulaka yau na mutindu ya mbote na 75% na kusadilaka logiciel R.
Ba nsangu ya luyantiku ya kulandana ya ARN (RNA-seq) ya ba lumba ya Nicotiana bakamaka na mikanda ya ntama ya kutanga ya nkufi ya NCBI (SRA), nimero ya kisalu kele PRJNA301787, yina Zhou na ba yankaka pesaka. (39) mpi kwenda mutindu bo me tubila yo na (56). Ba nsangu ya ntete yina ba me sala na W + W, W + OSM na W + OSS1 yina ke wakana na ba mitindu ya Nicotiana, ba me pona yau samu na kufiongunina yau na kulonguka yayi, mpe ba me sala yau na mutindu yayi: Ya ntete, ba kutanga ya ntete ya ARN-seq me baluka na mutindu ya FASTQ. HISAT2 ke balulaka FASTQ na SAM, mpi bisadilu ya SAM ke balulaka bafishe ya SAM na bafishe ya BAM ya bo me tula na ndonga. Bo ke sadilaka StringTie sambu na kuzaba mutindu ba gène ke basikaka, mpi mutindu na yo ya kubasisa yo kele nde kele ti bitini na kati ya bitini ya fondasio funda mosi na kati ya milio ya bitini ya bo me sonikaka na ndonga.
150 mm x 2,1 mm; nene ya bima 2,2 μm) yina ba sadilaka samu na kufiongunina mpe nzila ya kukengila ya 4 mm x 4 mm me salama na bima mosi. 10:10, 11. 10 Bau kesadilaka nzila yai ya zole na nzila ya ngidika ya bo kesadilaka sambu na kusala bansosa ya ngolo na zulu ya masa (UHPLC): 0 tii na 0,5, isocratique 90% A [masa ya kukonda ba ion, 0,1% (v/v) ya acetonitrile mpi 0,05% ya acide B. 0,05% ya aside ya formique); 0,5 tii na 23,5, fase ya kukulumuka kele 10% A mpi 90% B, na kulandana; 23,5 tii na 25, 10% ya A na 90% ya B. Kuluta ya masa kele 400μl/min. Samu na ba analyse nyonso ya MS, tula eluent ya colonne na kati ya analyseur ya quadrupole mpe ya ntangu ya kutambula (qTOF) yina kele na kisina ya masa ya kura yina ke salaka na mutindu ya ionisation ya mbote (tension ya ba nsinga ya kura, 4500 V; kubasika ya ba nsinga ya kura 130 V ; Tiya ya kuyuma 200°C d100).
Kusala analyse ya bitini ya MS / MS (na nima MS / MS) yina kele na mfunu ve to yina lenda swaswana ve na ba nsangu samu na kuzwa bansangu ya ntungulu na yina me tala mvingu ya bantu yina lenda zabana. Dibanza ya metode ya MS/MS ya kukonda kupona-pona me simbama na kieleka nde quadrupole kele ti fenetre ya nene kibeni ya kukatula masa [yo yina, tadila bidimbu yonso ya masa-na-charge (m/z) bonso bitini]. Na kikuma yayi, samu ti kisadilu ya Impact II lendaka ve kusala CE ya kukulumuka, ba analyse mingi ya kimpwanza salamaka na kusadilaka ba ntalu ya ngolo ya kubwa yina me katuka na kubwa (CE) yina me kuma mingi. Na bunkufi, ntete fimpa mbandu na nzila ya UHPLC-ionisation électrospray/qTOF-MS na kusadilaka mutindu ya spectrométrie ya masse mosi (ba nsiku ya fioti ya kukabula yina ke katukaka na kukabula na kati ya kisina), kutala na m/z 50 tii na 1500 na mbala ya kuvutukila ya 5 Hz. Sadila azote mutindu gaz ya kubula samu na kufiongunina MS/MS, mpe sala ba mesure ya kimpwanza na ba tension iya ya kuswaswana ya ke landa yina ke katukaka na kubula: 20, 30, 40, mpe 50 eV. Na nsungi yonso ya kutesa, quadrupole kele ti fenetre ya kukatula masa ya kuluta nene, banda na m/z 50 tii na 1500. Kana m/z ya nitu ya ntwala mpi eksperiansi ya nene ya kukatula masa me tulama na 200, bandinga ya masa ke salamaka na mbala mosi na nzila ya logiciel ya kisalu ya kisadilu mpi 0 Da. Scan sambu na bitini ya masa bonso na mutindu ya masa mosi. Sadila ml ya mvingu ya bantu (50 ml ya mvingu ya bantu, 200 ml ya acide formique mpe ml 1 ya masa ya NaOH 1M) samu na kuzaba ntalu ya bima. Na kusadilaka algorithme ya Bruker ya kufwanisa mambu na sikisiki yonso, bo kefwanisaka fichier ya bansangu na nima ya kusala nsangu ya mwayene na nsungi mosi buna. Sadila kisalu ya kubasisa bansangu ya logiciel Analyse des données v4.0 (Brook Dalton, Brême, Allemagne) sambu na kubalula bafishe ya bansangu ya ntete na mutindu ya NetCDF. Ba nsangu ya MS/MS me bumbana na kisika ya kukangula ya nsangu ya mvingu ya bantu (MetaboLights) na nimero ya kukota. 1471.
Kuvukisa ya MS/MS lenda salama na nzila ya kufiongunina ba nguizani na kati ya ba nsangu ya mbote ya MS1 na MS/MS samu na ngolo ya kubula ya fioti mpe ya nene mpe bansiku ya mpa yina ba me tula na bisalu. Bau kesadilaka script ya R samu na kubakisa analyse ya corrélation ya kukabula ya ntuadisi ya bima, mpe script ya C# (indiscriminant-MS-MS-assemblée-pipeline) kesadilamaka samu na kusadila bansiku.
Samu na ku kulumusa bifu ya mbote ya luvunu yina ke katukaka na makelele ya nsuka mpe nguizani ya luvunu yina ke katukaka na ku zaba bifu ya nkaka ya m/z kaka na mwa ba mbandu, beto ke sadilaka kisalu ya “peak ya kufuluka” ya paquet R XCMS (samu na ku sungika makelele ya nsuka) Fwete sadilama samu na ku yingisa “peak ya nsuka” (peak ya ku fuluka). Kana bo ke sadila kisalu ya kufulusa, kele kaka ti ntalu mingi ya “0′′ ya ngolo na kati ya kimvuka ya bansangu yina ta vanda ti bupusi na calcul ya corrélation. ntalu ya ngolo ti ntalu ya fondasio yina bo me tanga Beto tadilaka mpi kaka bikalulu yina ngolo na yo lutaka mbala tatu ntalu ya nsi mpi beto tadilaka yo bonso “bansongi ya kieleka.” Samu na ba nsangu ya PCC, kaka ba nsangu ya m/z ya ntuadisi ya mbandu (MS1) mpe ba nsangu ya bitini yina kele na ba nsuka ya kieleka ata nana ke tadisama.
Kana ngolo ya kikalulu ya kikalulu ya ntwala na kati ya mbandu ya mvimba kele na kuwakana ya ngolo ti ngolo ya kukulumuka ya kikalulu mosi ya kikalulu yina ke kutana ti ngolo ya fioti to ya ngolo ya kubula, mpi kikalulu yina me sonikama ve bonso nsongi ya isotope na CAMERA, bo lenda tendula yo diaka. Na nima, na kutangaka ba couple nyonso ya ntuala-bima yina lenda salama na kati ya 3 s (fenetre ya ntangu ya kubumba yina ba me banza samu na kubumba ya zulu), ba ke sala analyse ya corrélation. Kaka kana ntalu ya m/z kele na nsi ya ntalu ya ntuadisi mpe kukabwana ya MS/MS ke salama na kisika mosi ya mbandu na kati ya kimvuka ya bansangu na ntuadisi yina yau me katuka, yau ke tadisama mutindu kitini.
Na kutadila bansiku zole yayi ya pete, beto ke katulaka bitini yina me monisama yina kele na ntalu ya m/z ya kuluta m/z ya ntuadisi yina me zabana, mpe na kutadila kisika ya mbandu kisika ntuadisi ke monana mpe kitini yina me monisama. Yau lenda salama mpe na kupona bikalulu ya mbote yina ke basikaka na bitini mingi ya kati yina ke basikaka na mutindu ya MS1 mutindu ba ntuadisi ya candidat, na mutindu yina ba ke basisaka ba nsangu ya MS/MS yina ke vutukilaka. Samu na ku kulumusa mvingu ya ba nsangu yayi, kana kifwani ya NDP ya ba nsangu me luta 0,6, mpe yau kele na kati ya “kimvuka ya pc” ya mvingu ya bantu yina me sonikama na CAMERA, beto ke vukisa yau. Na nsuka, beto ke vukisa ba mvutu yonso iya ya CE yina ke wakana ti ntu-diambu mpi bitini na kati ya spectre ya nsuka ya bo me vukisa na kuponaka nsongi ya ngolo ya kuluta ngolo na kati ya bansongi yonso ya ke zola kukuma ti ntalu ya m/z ya mutindu mosi na bangolo ya kubula ya kuswaswana. Ba nzila ya kusadila yina ke landa me simbama na ngindu ya spectre composite mpe ke tadila ba mambu ya kuswaswana ya CE yina ke lombamaka samu na ku kumisa mingi kivuvu ya ku panzana, samu bitini ya nkaka lenda monana kaka na nsi ya ngolo ya ku kutana ya sikisiki.
RDPI (30) sadilaka samu na kuzaba mutindu ya kupesa nzila na mambu ya mvingu ya bantu. Kuswaswana ya ba nzila ya mvingu ya bantu (index ya Hj) me katuka na bunene ya ba ntuadisi ya MS/MS na kusadilaka entropie ya Shannon ya kukabula ba mbala ya MS/MS na kusadilaka mvingu ya bantu yina Martínez na ba yankaka me tubila. (8). Hj = −∑i = 1mPijlog2(Pij) kisika Pij ke wakana ti mbala ya kufwanana ya MS/MS ya i na kati ya mbandu ya j (j = 1, 2,..., m) (i = 1, 2, ..., m) t).
Kuzaba mambu ya mvingu ya bantu (index Si) ke tendula kimuntu ya mvingu ya bantu ya MS/MS mosi na yina me tala mbala na kati ya ba mbandu yina ba ke tadila. 1t (∑j = 1t)
Sadila formule yai sambu na kutesa ntalu ya δj ya konso mbandu ya j, mpi mwayene ya ntalu ya MS/MS δj = ∑i = 1mPijSi .
Ba spectre ya MS/MS ke tulamaka na ndonga zole-zole, mpe ba ke tangaka mutindu ya kufwanana na kutadila ba note zole. Na ntete, na kusadilaka NDP ya nsiku (yina me zabana mpi na zina ya metode ya kuwakana ya cosine), sadila ekwasio yai sambu na kupesa matonsi na mutindu ya kufwanana ya kitini na kati ya ba nzila ya NDP = (∑iS1 & S2WS1, iWS2, i) 2∑iWS1, i2∑iWS2, i2 kisika S1 ti S2 mutindu mbote na mutindu mosi, sambu na nzila ya nzila, 2.1. i ke monisa kilo yina me simbama na ngolo ya nsongi yina luswaswanu ya nsongi ya i-th ya kimvuka na kati ya ba spectre zole kele na nsi ya 0,01 Da. Kizitu ke tangamaka mutindu yayi: W = [ngolo ya zulu] m [kikalulu] n, m = 0,5, n = 2, mutindu MassBank me pesa ngindu.
Bau sadilaka mutindu ya zole ya kupesa matonsi, yina lombaka kufiongunina NL ya kukabula na kati ya MS/MS. Na nsuka, beto sadilaka ba liste 52 ya NL yina beto ke kutanaka na yau mbala mingi na ntangu ya kisalu ya kukabula MS na kimvuka, mpe NL ya kuluta sikisiki (fichier ya ba nsangu S1) yina me sonikama ntete samu na nzila ya MS/MS ya ba nsangu ya zole ya ba nsusu ya Nepenthes yina me lemba ( 9, 26 ). Kusala vecteur binaire ya 1 na 0 samu na konso MS/MS, yina ke wakana na ntangu yayi mpe yina kele ve ya NL ya nkaka. Na kutadila mutindu mosi ya ntama ya Euclide, bo ke tangaka ntalu ya mutindu mosi ya NL sambu na konso vecteur zole ya NL ya zole.
Na kusala bimvuka zole, beto sadilaka paquet R DiffCoEx, yina me simbama na kulandana ya Analyse de la co-expression génétique pondérée (WGCNA). Na kusadilaka ba nsangu ya NDP na NL ya ba nsangu ya MS/MS, beto sadilaka DiffCoEx samu na kuzaba nsangu ya ba nsangu ya kufwanisa. Kuvukisa bimvuka zole ke salamaka na kutulaka parametre “kuzengaDynamique” na metode = “kuvukisa”, KuzengaNtalu = 0,9999, Kukabula ya Mudindu = T, mpi Bunene ya Kimvuka ya Fioti = 10. (57); Ba logiciel ya R WGCNA yina ke lombamaka lenda monana na nzila ya ordinatere.
Na yina metala kusala bansosa ya réseau ya bamolekile ya MS/MS, beto salaka calcul ya réseau ya bamolekile zole yina mesimbama na mitindu ya kufwanana ya NDP ti NL, mpi beto sadilaka logiciel Cytoscape sambu na kumona na mabanza topologie ya réseau na kusadilaka ngidika ya bima ya kezingaka na kati ya nsiku ya kuyidika ya bima ya kezingaka.
Sadila R version 3.0.1 sambu na kusala bansosa ya ke tadila bansangu. Bau tadilaka mfunu ya ba ntalu na kusadilaka nzila zole ya kufiongunina ya luswaswanu (ANOVA), na nima ya kumeka ya Tukey ya luswaswanu ya mfunu ya masonga (HSD) na nima ya ntangu. Samu na kufiongunina luswaswanu na kati ya nkisi ya kudia matiti na yina ya kutala, kukabula ya mikila zole ya bimvuka zole ya ba mbandu yina kele na luswaswanu ya mutindu mosi, ba fimpaka yau na kusadilaka test t ya Student.
Sambu na kuzwa bima ya nkaka sambu na disolo yai, tala http://advances.sciencemag.org.
Yai kele disolo mosi ya bantu yonso lenda kota mpi bo me kabulaka yo na nsi ya bansiku ya Nswa ya Kupesa Bima-Kukonda Kusala Bisalu, yina ke pesaka nswa ya kusadila, kukabula mpi kubasisa yo na konso mutindu yina, kana kusadila ya nsuka kele ve sambu na mbongo ya mumbongo mpi kana lukanu kele nde kisalu ya kisina kele ya mbote. Referansi.
Noti: Beto ke lomba nge kaka na kupesa adresi na nge ya e-mail sambu muntu yina nge ke pesa zina na yandi na lutiti kuzaba nde nge ke zola nde yandi mona e-mail yina mpi nde yo kele ve e-mail ya mbi. Beto ta kanga ve ata adresi mosi ya ba e-mail.
Ngiufula yai ke sadisamaka sambu na kumeka kana nge kele munzenza mpi kukanga nzila na kutinda bansangu ya mbi na mbala mosi.
Théorie ya bansangu ke pesa mbongo ya yinza ya muvimba samu na kufwanisa ba metabolomes ya sipesiali mpe kuzabisa na ntwala ba théorie ya lutaninu ya kumeka.
Théorie ya bansangu ke pesa mbongo ya yinza ya muvimba samu na kufwanisa ba metabolomes ya sipesiali mpe kuzabisa na ntwala ba théorie ya lutaninu ya kumeka.
©2021 Kimvuka ya Amerika sambu na Kuyela ya Siansi. banswa yonso kele ya bo me bumba. AAAS kele nduku ya HINARI, AGORA, OARE, CHORALE, CLOCKSS, CroixRef mpi COMPTEUR. 2375-2548.

Ntangu ya kutinda: 22-22-2021